Las flores, frutos, semillas y órgano subterráneo de Piper amalago var. medium Linnaeus fueron analizados estructuralmente.
La flor es aclamídea, monoclina, con dos estambres y gineceo con tres carpelos. La antera es tetrasporangiada, cuya pared está constituida por epidermis, endotecio, una o dos capas medias y tapete secretor. El ovario tiene estructura simple, con meristemo ventral. El único óvulo es ortótropo, crasinucelado y con dos tegumentos. El fruto es una drupa. La semilla es endotegmica y perispermada. El putamen está compuesto por el mesocarpio interno y endocarpio esclerificado. Los individuos de la especie pueden estar interligados por un órgano subterráneo de naturaleza radical que puede propagarse vegetativamente.
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