El aislamiento y purificación de los polímeros de poli-hidroxibutirato (PHB) con hipoclorito de sodio es una metodología sencilla y barata. La adición de EDTA 10 mM en mezcla con el hipoclorito de sodio mejora notablemente la pureza del producto final. La extracción del PHB utilizando solventes orgánicos como el cloroformo, el dicloroetano y el cloruro de metileno ha resultado ser una metodología poco factible desde el punto de vista económico debido a que se requieren grandes cantidades de solventes para lograr la purificación parcial del polímero. La cuantificación del PHB por el método espectrofotométrico tradicional es sencilla pero sobrestima los resultados porque no solo las unidades monoméricas del polímero pueden convertirse a ácido crotónico después del tratamiento con ácidos orgánicos. Esto puede mejorarse si previo a la determinación se realiza una etapa de extracción del polímero y el tratamiento con ácidos orgánicos se realiza en presencia de EDTA 10 mM. El uso de la cromatografía líquida de alta eficacia (HPLC) y líquida-gaseosa (GLC) resulta particularmente ventajoso para la cuantificación del PHB. El tratamiento ácido de las muestras para su posterior análisis por HPLC no es recomendable para polímeros que contengan unidades monoméricas de más de cuatro átomos de carbono debido a que el porciento de conversión a ácido crotónico es diez veces menor. Sin embargo el tratamiento de estas muestras con alcalis ha resultado ser efectivo.
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