Los principales procesos fisicos de gran escala que tienen lugar en el Lago de Banyoles son revisados como tributo al profesor Margalef. Estos procesos incluyen los flujos de agua bajo la superficie del lago, el comportamiento del sedimento en suspensión en las cubetas, los flujos de calor en la superficie y en el fondo, las secas internas y la formación de corrientes baroclínicas debido a la diferencia de enfriamiento entre los dos lóbulos, la dinámica de mezcla, el comportamiento meromíctico de algunas de las cubetas y la formación y dinámica de las plumas hidrotérmicas.
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