La identificación específica de parásitos utilizando técnicas morfológicas son lentas y consumidoras de tiempo, requiriendo preparaciones de alta calidad donde cada estructura taxonómicamente importante pueda ser observada con claridad, y además debe llevarse a cabo una consulta con un experto en taxonomía.; La información de color llega a ser un importante rasgo discriminativo, el cual necesitamos incluir en el proceso completo de identificación. Imágenes digitales de las monogeneas Heterobothrium ecuadori y Neobenedenia melleni, y las digeneas Lintonium vibex, Homalometron longisinosum, Bianium plicitum, y Phyllodistomum mirandai, fueron procesadas para obtener la magnitud de su transformada de Fourier para proveer un método rápido para identificar parásitos por profesionales no expertos en sistemática. Se llevó a cabo una simulación numérica para correlacionar la magnitud de la transformada de Fourier de las diferentes especies de parásitos con filtros sólo de fase. El reconocimiento de la imagen invariante a posición, rotación y a escala fue llevada a cabo a través del uso de la transformada de escala y un mapeo polar. Hemos desarrollado un método exitoso para la descriminación entre especies parásitas de platelmintos. Para maximizar el potencial de este método, es necesario tener un gran banco de datos de este tipo de imágenes, el cual debería incluir imágenes digitales de las principales especies de parásitos encontrados para que de esta forma apliquemos esta técnica y continuar así con esta investigación. Este trabajo es una base para el desarrollo de un sistema automatizado para la identificación de parásitos en Sphoeroides annulatus
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