Sobre la simulación de procesos de evolución molecular: consideraciones sobre la derivación y contrastación de un estimador de la varianza de la divergencia nucleotídica a partir de fragmentos de restricción

• Autores: Santiago F. Elena, Andrés Moya Simarro, Fernando González Candelas
• Localización: Questiió: Quaderns d'Estadística, Sistemes, Informatica i Investigació Operativa, ISSN 0210-8054, Vol. 20, Nº. 2, 1996, págs. 327-346
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • On the simulation of molecular evolutionary processes: considerations on the derivation and confirmation of an estimator for the variance of nucleotide divergence estimated from restriction fragments
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• Resumen

  • Una de las áreas de la Biología que ha experimentado mayor expansión en los últimos años es la investigación de procesos evolutivos mediante la aplicación de técnicas de la Biología Molecular. La puesta en marcha de programas de obtención de información cartográfica de genes y de secuencias de los mismos no ha hecho más que aumentar esta tendencia. La investigación de procesos evolutivos lleva emparejada el contraste de hipótesis alternativas, tales como el orden de división de los linajes en una reconstrucción filogenética o las estimas de distancias entre los nodos de un árbol filogenético. Existen modelos evolutivos que, bajo supuestos más o menos restrictivos, han permitido la construcción de tests paramétricos de contraste de hipótesis. Una de las dificultades que se encuentra en el desarrollo de estos tests es la derivación de las propiedades de los estadísticos correspondientes. En tales situaciones es muy frecuente recurrir a la simulación de procesos de evolución para, así, contrastar la bondad de los estadísticos. En este trabajo exponemos la derivación de un estimador de la varianza de la divergencia nucleotídica a partir de la comparación de los fragmentos producidos por la digestión con endonucleasas de restricción del DNA de especies descendientes de un ancestro común y los resultados de las simulaciones realizadas para comprobar su bondad, prestando especial atención al efecto que tienen sobre los resultados de la simulación distintos parámetros inicialmente considerados no relevantes y la importancia de establecer controles rigurosos e independientes sobre las simulaciones