Se han buscado metodologías capaces de diferenciar genéticamente la perdiz roja (Alectoris rufa) de otras especies de perdiz que hibridan con ella (principalmente perdiz chukar, A. chukar) y pueden por tanto poner en peligro la subsistencia de la perdiz roja. Los procedimientos empleados en el presente trabajo se basan en la detección de polimorfismos de una única base nucleotídica (SNPs). Cuando el nucleótido diferente para las distintas especies forma parte del sitio de restricción se detecta mediante el empleo de enzimas de restricción (RFLP). Otra alternativa es la discriminación alélica con PCR a tiempo real (RT-PCR) mediante el empleo de sondas marcadas con fluorocromos diferentes para el alelo de cada especie. Ambas metodologías han demostrado su eficacia en la diferenciación de especies e incluso en la identificación de híbridos tanto en ejemplares silvestres como en aquellos criados en cautividad.
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