A pesar de las recomendaciones y ordenanzas en los últimos años, los ambientes naturales han recibido un creciente aporte de efluentes industriales y domésticos que han llevado al deterioro de muchos ecosistemas y cursos de agua haciéndolos incompatibles con la vida. Aquellos materiales tóxicos o indeseables deben ser tratados para hacerlos inocuos, los materiales inorgánicos como sedimentos u otros residuos pueden ser tratados por procesos fisico-químicos, pero los residuos con una carga orgánica importante deben sufrir un tratamiento microbiológico para su degradación (biorremediación). En este aspecto podemos destacar el papel del género Zoogloea en la degradación de la materia orgánica y bioadsorción de metales, destacando la especie Zoogloea ramigera, por encima del resto.
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