El estudio de los ecosistemas acuáticos (ríos, lagos, embalses, humedales, etc.) se ha convertido, en las últimas décadas, en un elemento clave para mejorar el conocimiento sobre la estructura de las comunidades que los habitan y la relación entre estas y su entorno. Esta estructura y composición de las comunidades de un ecosistema acuático depende, en mayor o menor medida, de una serie de interacciones bióticas (depredación, competencia, etc.) y de la, a su vez, estructura y composición de los hábitats presentes, cualidades que pueden variar a lo largo del tiempo y del espacio. En general, un mayor conocimiento de los sistemas fluviales debe permitir diagnosticar, de manera integral, el grado de alteración que sufren estos y proponer los modelos de gestión y protección más adecuados.
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