Resumen de Perfil de expresión génica en el cáncer de próstata: identificación de marcadores candidatos para el diagnóstico no invasivo
L. Mengual, Elisabet Ars, J.J Lozano, M Ingelmo Torres
Objetivo Analizar los perfiles de expresión génica del cáncer de próstata (CaP) e identificar los genes diferencialmente expresados. Determinar si la expresión diferencial en tejido se mantiene en muestras de orina-posmasaje prostático (PMP).
Material y métodos Un total de 46 muestras de tejido prostático (36 de pacientes con CaP y 10 controles) y 158 orinas-PMP (113 de pacientes con CaP y 45 controles) se recogieron entre diciembre de 2003 y mayo de 2007. Se utilizaron microarrays de ADN para identificar los genes diferencialmente expresados entre las muestras de tejido tumorales y las controles. Diez genes fueron seleccionados para la validación técnica de los microarrays en las mismas muestras tisulares mediante PCR cuantitativa (RT-qPCR). Se seleccionaron 42 genes para ser validados en muestras de orina-PMP mediante RT-qPCR.
Resultados El gráfico de escalado multidimensional mostró una clara separación entre las muestras de tejido tumorales y las controles. Se han identificado 1.047 genes diferencialmente expresados (FDR ? 0,1) entre los 2 grupos. La correlación entre los datos de microarrays y RT-qPCR fue alta (r = 0,928, p < 0,001). Trece genes mantuvieron el mismo sentido de expresión diferencial al ser analizados en orinas-PMP y 4 de ellos (HOXC6, PCA3, PDK4 y TMPRSS2-ERG) mostraron diferencias de expresión estadísticamente significativas entre orinas-PMP tumorales y controles (p < 0,05).
Conclusión Existe un perfil de expresión génica diferencial en el CaP. Aunque la extrapolación de la expresión génica obtenida en tejido prostático a orina-PMP se debe realizar con precaución, el análisis del tejido prostático permite la identificación de nuevos biomarcadores para diagnóstico no invasivo del CaP.
