A aptidão do solo para suportar o crescimento das plantas depende do meio ambiente. Os fatores físicos, químicos e biológicos são indispensáveis para a nutrição vegetal e estão intimamente associados com a matéria orgânica edáfica, através da atividade dos microrganismos no solo. Os mesmos constituem um vasto conjunto sistemático de bactérias actinomicetos, fungos, protozoários e algas. Em geral, o nível de micro-organismos no solo está positivamente correlacionado com o nível de matéria orgânica, a qual está associada principalmente com a parte superior (30-40 cm) do solo. Em conjunto, estes organismos podem ser capazes de substituir fertilizantes minerais e agrotóxicos, diminuindo despesas, reduzindo a poluição e causalidades ambientais. Grande número de interações podem ocorrer entre espécies, ou seja, comportamento independente, associação com plantas, associação mútua e supressão de espécies. A possível supressão de grupos microbianos tem sido testada com muitos herbicidas, inseticidas, fungicidas e uma variedade de diferente populações tem sido avaliada em comparações de solos tratados e não tratados.
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