Resumen de Estudio genético molecular de nuevos biomarcadores para el diagnóstico precoz del carcinoma oral de células escamosas
Kim Yong Deok, Jeon Eun Hyoung, Kim Yeon Sun, Pang Kang Mi, Lee Jin Yong, Cho Sung Hwan, Kim Tae Yun, Park Tae Sung, Kim Soung Min, Kim Myung Jin, Lee Jong Ho
Objetivos: La detección y el tratamiento tempranos del carcinoma oral de células escamosas (COCE) es importante debido a su rápido crecimiento, por la frecuencia de metástasis ganglionar y a su mal pronóstico. Sin embargo, no existen métodos clínicamente efectivos para el diagnóstico precoz, y los análisis genéticos de los COCEs no han dado biomarcadores.
Diseño del estudio: Se investigó la expresión de los genes asociados con la inflamación en los COCEs mediante análisis de los datos de microarrays, vía reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa cuantitativa (qRT-PCR).
Para el análisis de microarrays se utilizaron muestras de tejido tumoral y sano de 5 pacientes con COCE. Se seleccionaron como marcadores genéticos candidatos, genes con expresión diferencial, identificados mediante test de permutación, test de error local combinado (ELC), test t y el algoritmo SAM (Significance Analysis of Microarrays).
Resultados: Se evidenciaron dos grupos correspondientes a la identidad de los tejidos, lo que implicaba que sus genes expresados de forma diferente, representaban diferencias biológicas entre los tejidos. Se identificaron quince genes con el test t de Student emparejado (p < 0,05) y el SAM, con una tasa de falso hallazgo de menos de 0,02. Basándose en la expresión génica, estos 15 genes pueden utilizarse para clasificar un COCE. Un análisis genético de las redes funcionales y las ontologías, validado mediante análisis de muestras de tejido con qRT-PCR, identificaron cuatro genes, ADAM15, CDC7, IL12RB2 y TNFRSF8, que demostraron una excelente concordancia con los datos de microarrays.
Conclusiones: Nuestro estudio demostró que cuatro genes (ADAM15, CDC7, IL12RB2 y TNFRSF8) tenían potencial como nuevos biomarcadores para el diagnóstico y el tratamiento de un COCE.
