Comparación de dos métodos de detección de Spongospora subterranea F. Sp. Subterranea en raíces de plantas hospederas

Arcila Aristizabal, Ivon Magaly ^[1] ; Zuluaga Amaya, Catalina María ^[2] ; Marín Montoya, Maurio Alejandro ^[3] ; Cotes Torres, José Miguel ^[3] ; González Jaimes, Elena Paola ^[2]
1. [1] Universidad Nacional de Colombia
  
  Universidad Nacional de Colombia
  
  Colombia
2. [2] Politécnico Colombiano Jaime Isaza Cadavid
3. [3] Universidad Nacional Colombia - Sede Medellín
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Localización: Revista de la Facultad de Ciencias Básicas, ISSN-e 1900-4699, Vol. 9, Num. 2, 2013
Idioma: español
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Resumen
- En esta investigación se compararon dos métodos de detección de Spongospora Aterranea f. sp. subterranea en raíces de plantas hospederas, mediante observación microscópica y PCR en tiempo real (qPCR). Para esto, se evaluaron 20 especies vegetales que fueron inoculadas con una concentración de 1,25x105 quistosoros.g-1 de suelo. Fue obtenida una muestra de raíz tres meses después de inoculación para determinar la presencia de estructuras morfológicas mediante dos metodologías: microscopía de luz previa tinción con azul de tripano y qPCR usando el sistema Taqman con los cebadores SponF y SponR y la sonda específica SponP. Estos cebadores amplifican un fragmento de 138 pb de la región ITS2 del ADN ribosomal. Para cuantificar la concentración de quistosoros en los tejidos evaluados, se realizó una curva estándar a partir de diluciones seriadas de 1,25x107 to 1,25x103 cystosori.mL-1, y se estimó el valor del ciclo umbral (Ct) para cada muestra desconocida con relación a la curva estándar. Finalmente, se analizaron los datos con el coeficiente de Kappa para determinar el grado de concordancia entre ambos métodos. Se encontró que los métodos utilizados presentaron un grado de acuerdo leve (0.19) en la detección e identificación de S. subterranea f. sp. subterranea en raíces de diversas plantas hospederas.