Las tendencias de los últimos 20 años indican a nivel mundial un aumento de la contaminación marina, una aceleración de la destrucción de los hábitats marino-costeros y, en muchas áreas una menor captura de especies marinas afectadas por la pesca excesiva y la contaminación. Se estudiaron (1995-1996) los patrones de transporte de nutrientes, la estacionalidad del oxígeno y de los nutrientes disueltos; la escorrentía de los principales ríos, su aporte de nutrientes y su contribución sobre los niveles de clorofila-a (como aproximación a biomasa de fitoplankton); distribución de metales pesados en los sedimentos y el contenido de metales de la biota como posibles bioindicadores; el modelaje hidrodinámico de los procesos de transporte y circulación de las aguas en el Golfo de Nicoya, así como el modelaje parcial de la dinámica de los nutrientes.
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