Conectividad en evaluaciones genéticas de animales: 2. Comparación de metodologías

• Autores: Fabián Magaña Valencia, Rafael Núñez Domínguez, Rodolfo Ramírez Valverde, Felipe Alonso Rodríguez Almeida
• Localización: Agrociencia, ISSN 2521-9766, ISSN-e 1405-3195, Vol. 47, Nº. 8, 2013, págs. 781-794
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Connectedness in animal genetic evaluations: 2. Comparison of methodologies
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    El propósito de este estudio fue comparar los principales métodos pata estimar la conectividad entre grupos contemporáneos (GC) en una población simulada, considerando una misma estructura de datos. Se simuló una población de 37 bovinos, de los cuales 15 tuvieron registros de peso al destete en uno de tres GC, en siete escenarios con diferente grado y tipo de conectividad (directa e indirecta). En cada escenario se realizaron contrastes entre los GC y se determinaron sus conectividades con 10 métodos cuantitativos. Los criterios para comparar los métodos fueron: capacidad para identificar GC desconectados, y conectados directa e indirectamente; y consistencia, definida como la relación entre el grado de conectividad obtenida y la simulada al aumentar progresivamente el número de reproductores en común entre GC, a través de los escenarios. Además, se obtuvieron coeficientes de correlación entre los grados de conectividad. Los métodos varianza del error de predicción de las diferencias en valores genéticos entre animales, flujo de genes, número de lazos genéticos directos totales debido a sementales y hembras comunes, e índice de conectividad mostraron tendencias en los valores de conectividad consistentes con el incremento en el número de sementales o vientres en común a través de los siete escenarios simulados. De estos métodos, sólo el de número de lazos genéticos directos detectó grupos contemporáneos desconectados, además de estar altamente correlacionado (-0.97) con la varianza del error de predicción de las diferencias en valores genéticos entre animales. Por tanto, se sugiere usar el método de número de lazos genéticos directos en evaluaciones genéticas rutinarias de bovinos.

  • English

    The purpose of this study was to compare the main methods to estimate connectedness among contemporary groups (CG) in a simulated population, considering a single structure of data. A population of 37 cattle was simulated, of which 15 had records of weaning weight in one of three CG, in seven scenarios with different degrees and types of connectedness (direct and indirect). In each scenario contrasts were performed among the CG and their connectedness was determined with 10 quantitative methods. The criteria for comparing the methods were: capacity to identify CG disconnected, and connected directly or indirectly; and consistency, defined as the relationship between the degree of obtained vs. simulated connectedness by progressively increasing the number of sires and dams in common among CG, through the scenarios. In addition, correlation coefficients were obtained between the degrees of connectedness. The prediction error variance methods of the differences in genetic values among animals, gene flow, total number of direct genetic links due to common sires and dams, and connectedness index showed trends in connectedness values consistent with the increase in the number of sires or dams in common through the seven simulated scenarios. Of these methods, only that of number of direct genetic links detected disconnected contemporary groups, besides being highly correlated (-0.97) with the prediction error variance of the differences in genetic values among animals. Therefore, it is suggested to use the method of total number of direct genetic links in routine genetic evaluations of cattle.