ISSR molecular markers for the study of the genetic diversity of Mimosa caesalpiniaefolia Benth

• Autores: Fernando dos Santos Araújo, Mauro Vasconcelos Pacheco, Fábio de Almeida Vieira, Cibele dos Santos Ferrari, Francival Cardoso Félix, Kyvia Pontes Teixeira das Chagas
• Localización: Idesia, ISSN-e 0718-3429, ISSN 0073-4675, Vol. 34, Nº. 3, 2016, págs. 47-52
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Marcadores moleculares ISSR para el estudio de la diversidad genética de Mimosa caesalpiniaefolia Benth
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  • español

    Conocer la diversidad genética de las especies de árbolesforestales en la región semiárida de Brasil puede contribuir al desarrollo de estrategias eficaces para su conservación y usofuturo. El objetivo de este estudiofue seleccionar iniciadores de ISSR (Secuencias Intergénicas Repetidas Simples) capaces de detectar polimorfismo genético entre individuos de Mimosa caesalpiniaefolia Benth. para estudiar la diversidad genética de la especie. Un total de 27 iniciadores ISSR fueron probados por su capacidad para amplificar el ADN genómico de tres individuos. Todos los iniciadores amplificaron secuencias intergénicas repetidas en el genoma, pero siete fueron seleccionados porque presentaron un mejor patrón de amplificación. Los siete iniciadores seleccionados fueron utilizados para amplificar el ADN genómico a partir de nueve individuos y generaron un total de 78 loci, 52,7% de los cualesfueron polimórficas. El valor del contenido de la información de los iniciadores polimórficos varió de 0,261 a 0,489, demostrando que son moderadamente informativo y el análisis del impulso se determinó que 51 loci fueron suficientes para estimar la diversidad genética de la muestra de los individuos analizados. Los resultados indican que los marcadores generados por los iniciadores UBC 807, UBC 824, UBC 827, UBC 840, UBC 851, UBC 873 y UBC 881 permiten detectarpolimorfismo genético entre individuos de M. caesalpiniaefolia y pueden ser utilizados para estimar la diversidad genética para esta especie.

  • English

    Knowledge of the genetic diversity of the threatened tree species in the Brazilian semiarid region may contribute to the creation of effective strategies for their preservation and future use. The aim of this study was to select ISSR (Inter-Simple Sequence Repeat) primers capable of detecting genetic polymorphism among Mimosa caesalpiniaefolia Benth. individuals for a study of the genetic diversity of this species. A total of 27 ISSR primers were tested for their ability to amplify genomic DNA of three individuals (bulk); all of them amplified regions between the simple sequence repeats of the genome, however seven ISSR primers showed a good standard of amplification compared to the others. The seven primers selected were used to amplify the genomic DNA of nine individuals and generated a total of 78 loci, of which 52.7% were polymorphic. The content of polymorphic information of the primers ranged from 0.261 to 0.489, showing that selected primers are moderately informative; bootstrap analysis determined that 51 loci were enough to estimate the genetic diversity of the samples of individuals. We concluded that the markers generated by the primers UBC 807, UBC 824, UBC 827, UBC 840, UBC 851, UBC 873 and UBC 881 allow detection of the genetic polymorphism among individuals of M. caesalpiniaefolia, being useful to determine the genetic diversity of this species.