Para comprender íntegramente el papel de los microorganismos de la naturaleza, primero debemos considerar el concepto de ecosistema. El grupo de trabajo definió ecosistema como comunidad de organismos junto con el entorno físico y químico en el que viven. Cada organismo interactúa con su entorno físico y químico y con otros organismos incluyendo el huésped en el sistema, de forma que los ecosistemas pueden considerarse como una forma de superorganismo con la capacidad de responder a una modificación de su entorno.
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