Identificación de polimorfismos de nucleótido simple en centenarios

• Autores: Juan Gambini Ricapa, Lucía Gimeno-Mallench, Marta Inglés de la Torre, Gloria Olaso, Kheira Mohamed Abdelaziz, Juan Antonio Avellana Zaragoza, Ángel Belenguer, Raquel Cruz, Cristina Mas Bargues, Consuelo Borrás Blasco, José Viña Ribes
• Localización: Revista española de geriatría y gerontología: Órgano oficial de la Sociedad Española de Geriatría y Gerontología, ISSN-e 1578-1747, ISSN 0211-139X, Vol. 51, Nº. 3 (Mayo / Junio), 2016, págs. 146-149
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Identification of single nucleotide polymorphisms in centenarians
• Enlaces
  • Texto completo
• Resumen
  • español

    Introducción La longevidad viene determinada por la genética propia de cada especie y por factores externos, tales como nutricionales, ambientales, sociales, etc. Sin embargo, los individuos más longevos se caracterizan por presentar una mayor adaptación al entorno condicionada predominantemente por su propia genética. Dentro de una misma población con relativa homogeneidad genotípica, podemos encontrar cambios sutiles en la secuencia de ADN que afectan únicamente a un nucleótido. Estos cambios denominados polimorfismos de nucleótido simple (Single Nucleotide Polimorphisim [SNP]) se encuentran con una prevalencia mayor al 1-5% de la población. Por ello, nos planteamos estudiar en individuos centenarios si las posibles variaciones genéticas, analizando SNP, podrían tener alguna relevancia en la longevidad extrema que experimentan.

    Material y métodos Se reclutó a 92 sujetos: 28 centenarios y 64 controles. Se les extrajo sangre, se aisló y amplificó ADN para el análisis de SNP mediante la tecnología Axiom™ Genotyping de Affymetrix. Los análisis estadísticos se realizaron mediante el programa Plink y varias bibliotecas de R para Windows (library SNPassoc, skatMeta).

    Resultados Los resultados del análisis muestran 12 SNP que presentan un valor de p inferior a 0,001, donde 5 de ellos (DACH1, LOC91948, BTB16, NFIL3 y HDAC4) tienen funciones reguladoras de la expresión de otros genes.

    Conclusiones Así pues, los resultados sugieren que las variaciones genéticas observadas entre centenarios y controles tienen lugar en 5 genes que están implicados en la regulación de la expresión génica, capacitándolos a adaptarse a diferentes condiciones ambientales con mejor éxito.

  • English

    Introduction Longevity is determined by genetic and external factors, such as nutritional, environmental, social, etc. Nevertheless, when living conditions are optimal, longevity is determined by genetic variations between individuals. In a same population, with relative genotypic homogeneity, subtle changes in the DNA sequence affecting a single nucleotide can be observed. These changes, called single nucleotide polymorphisms (SNP) are present in 1-5% of the population.

    Material and methods A total of 92 subjects were recruited, including 28 centenarians and 64 controls, in order to find SNP that maybe implicated in the extreme longevity, as in the centenarians. Blood samples were collected to isolate and amplify the DNA in order to perform the analysis of SPN by Axiom™ Genotyping of Affymetrix technology. Statistical analyses were performed using the Plink program and libraries SNPassoc and skatMeta.

    Results Our results show 12 mutations with a p<.001, where 5 of these (DACH1, LOC91948, BTB16, NFIL3 y HDAC4) have regulatory functions of the expressions of others genes.

    Conclusions Therefore, these results suggest that the genetic variation between centenarians and controls occurs in five genes that are involved in the regulation of gene expression to adapt to environmental changes better than controls.