Estudio de genética poblacional de Polylepis pauta y Polylepis serícea en Pichincha mediante la utilización de marcadores moleculares SSRs

• Autores: Rosa Andrade, Mónica Jadán, María Claudia Segovia Salcedo
• Localización: Revista Ecuatoriana de Medicina y Ciencias Biológicas: REMCB, ISSN-e 2477-9148, ISSN 2477-9113, Vol. 34, Nº. 1-2, 2013, págs. 27-45
• Idioma: español
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    Los bosques de Polylepis son centros de biodiversidad con alto impacto antropogénico. En nuestro país no existen estudios de estructura genética en el género, información indispensable para su conservación genética. El presente estudio se centra en dos especies con conflicto taxonómico: P. pauta y P. sericea en la provincia de Pichincha (Yanacocha, Mojanda y Cayambe-Coca). En total se analizaron 142 individuos de las tres poblaciones. El ADN se extrajo mediante el método CTAB para luego amplificarlo con cinco microsatélites diseñados para este género. Se detectaron 18 alelos compartidos entre las dos especies. El análisis mediante Structure reveló la existencia de dos grupos.

    El primero conformado por Cayambe-Coca y Mojanda y el otro por Yanacocha. Los valores de heterocigocidad observada (Ho) en Cayambe-Coca, Mojanda y Yanacocha fueron de 0.576 y 0.299. Mientras que la esperada (He) fue de 0.605 y 0.524. La mayor diferencia corresponde a Yanacocha y se puede atribuir a la selección a favor de un alelo o endogamia. Mediante análisis de diferenciación se comprobó que ambos grupos son diferentes con p=0.00072 (α=0.05). AMOVA mostró que la mayor variación corresponde a dentro de las poblaciones (88 %). El análisis de agrupamiento detectó dos grupos: el primero conformado por Cayambe-Coca y Mojanda, y el segundo por Yanacocha.

    Sin embargo, se detectó un agrupamiento diferente para la subpoblación Mojanda 1 (P. pauta x P. incana). No se encontró correlación entre distancia genética y distancia geográfica. En este estudio se pudo diferenciar a ambas especies molecularmente, por lo cual se demuestra que los SSRs diseñados fueron marcadores poderosos en análisis de diversidad, diferenciación y estructura en este género.

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    Polylepis forests are one of the most vulnerable centers of Andean diversity that have been affected by anthropogenic impacts. In Ecuador there are no studies of genetic structure in this genus, which is fundamental information for genetic conservation.

    This study analyzed two species with taxonomic uncertainty, P. pauta and P. sericea, in three populations: Yanacocha, Mojanda, and Cayambe-Coca National Park. Each population consisted of three subpopulations with a total of 142 individuals. DNA was extracted using the CTAB method and was amplified with 5 SSR primers designed for this genus. Eighteen alleles were detected between the two species. Analysis for genetic structure detected two groups. The first one contained the Cayambe-Coca and Mojanda populations and Yanacocha was in the second group. The observed heterogeneity (Ho) for the Cayambe-Coca and Mojanda population was 0.576, and 0.299 for the Yanacocha population. In contrast, the expected heterogeneity (He) was 0.605 and 0.524 for the populations in Cayambe-Coca and Mojanda and Yanacocha. The biggest difference between these statistics was in the Yanacocha population. This could be attributable to one allele selection or inbreeding. Through differentiation analysis it was probed that both population established are different p=0.00072 (α=0.05). The largest source of variation corresponds to within populations differences (AMOVA). Clustering analysis detected a significant clustering in a subpopulation from Mojanda (Moj1). This may be due to a hybrid origin (P.pauta x P. incana) of this population. Correlation between genetic and geographic distance was not detected. Through this study it was possible to differentiate both species; therefore, SSRs were powerful markers to detect genetic diversity, differentiation, and population structure in this genus.