Existen diversos cementos selladores y materiales de obturación endodóntica que aseguran propiedades de selle y adaptación que disminuye la filtración bacteriana a través del foramen apical reconociéndose este como el resultado ideal de un tratamiento endodóntico. Objetivo: El propósito del estudio fue comparar el grado de microfiltración del sistema guttaflow y el cemento topseal, cuando son usados como materiales de obturación endodóntica en dientes instrumentados con sistema rotatorio Protaper. Materiales y Métodos: Estudio cuasi-experimental donde se utilizaron 40 dientes monorradiculares, donde el grupo I fue obturado con Topseal® y el grupo II con GuttaFlow®. Resultados: Se encontró que el grupo I (Topseal) la extensión de la microfiltración medida en milímetros fue desde 0 mm hasta 2 mm con una media de 0,33 ± 0,59 de DE, una mediana 0 con un rango interquantílico de 0-1. Se encontró que el grupo II (Guttaflow), la extensión de la microfiltración medida en milímetros fue desde 0 mm hasta 3 mm. Con una media de 0,5 ± 0.89), de una mediana 0 con un rango interquantilico 0-1. Al comparar la mediana de los dos grupos (grupo I: Topseal y grupo II: Guttaflow) se encontró que no había diferencia estadísticamente significativa, p=0.7463; (p>0,05). Conclusión: No se encontró diferencia estadísticamente significativa al utilizar cemento sellador Topseal y Guttaflow con cono único como material de obturación en dientes instrumentados con Protaper rotatorio
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