Alfred Bögli est né à Berne en 1912. Il étudie la géologie et la géographie aux universités de Berne et de Fribourg, et accomplit son cursus en 1939 par une thèse sur la géomorphologie de la haute vallée du Rhône (vallée de Conches). Il occupera ensuite de 1941 et jusqu'à sa retraite en 1977 un poste de professeur en sciences naturelles à l'école normale à Hitzkirch (canton de Lucerne). Au milieu des années quarante, il commence ses recherches dans le Muotatal, en Suisse centrale. Ce contact avec le karst est un événement marquant, puisque ce thème le passionnera toute sa vie. Il s'intéressera principalement aux mécanismes de corrosion du calcaire et à la morphologie karstique, en particulier la typologie des karrens ; par la suite il abordera aussi l'hydrologie du karst. Son activité constante de publication et de présentation de conférences lui vaudra une grande notoriété.
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