Los manglares contribuyen al mantenimiento de los procesos funcionales y productivos de los sistemas costeros, en la actualidad enfrentan presiones antropocéntricas y ambientales que alteran la estructura y ponen en riesgo su desarrollo. Este trabajo se realizó con la finalidad de analizar los parámetros ecológicos de la comunidad ictiofaunística en zonas de manglar de forma estacional e interanual. Los parámetros se registraron en 10 estaciones donde se colectaron los peces con un chinchorro de 50 m., en el período de 1995 a 2012. Los registros ambientales se sometieron a un ANOVA por año. Para evaluar la diversidad y la dominancia entre años, se utilizaron los índices de Shannon-Wiener y de McNaughton. Los datos de abundancia y por año se analizaron mediante un escalamiento multidimensional (MDS). Los parámetros fisicoquímicos muestran diferencias significativas para los años 1995, 1998, 2002 a 2005, 2007 y 2010. Se capturaron 46939 organismos con una biomasa de 604058.8 g., pertenecientes a 82 especies. El efecto de la elevación de temperatura y la variación en las lluvias, ha favorecido la incursión de especies marinas al sistema y en particular a las zonas de manglar incrementando la riqueza específica pero disminuyendo los valores de diversidad y de la equitatividad. La relación entre los cambios ambientales y su efecto sobre la fluctuación en la abundancia de las especies, es un aspecto que debe ser estudiado con la finalidad de predecir los posibles impactos en los aspectos socioeconómicos en el sistema lagunar de Alvarado.
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