Los avances en el campo de la detección e identificación de microorganismos están muy desarrollados en el campo de la Microbiología Clínica. El nivel de criticidad que exige una rápida resolución a nivel clínico de una situación de rutina, frente al que pueda suponer una rápida detección a nivel ambiental, puede explicar por qué la tecnología avanza más rápidamente en el ámbito clínico. Si hablamos de identificación de microorganismos, hoy en día a nivel hospitalario, a partir de un cultivo en placa y con un simple procedimiento que puede llevar como máximo 10 minutos de trabajo, puede identificarse un microorganismo mediante la tecnología matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI- TOF MS), siempre y cuando se disponga de una base de datos adecuada. Estas bases de datos ya son de uso comercial en el campo clínico, pero todavía no están disponibles a nivel comercial en el sector ambiental. Si hablamos de detección de microorganismos, de nuevo en el Laboratorio de Microbiología del hospital se pueden encontrar fácilmente sistemas rápidos o muy rápidos de screening de patógenos. Estos equipos sólo requieren de una muestra con una gran concentración de un microorganismo patógeno para que éste pueda ser detectado fácilmente. El tipo de muestra que se requiere (muestra altamente concentrada de microorganismo patógeno) es una muestra típica en el ámbito clínico pero, de nuevo, no es habitual en el campo del análisis ambiental. Los últimos proyectos de I+D en los que ha participado el Laboratorio de Aguas de Barcelona -AQUAVALENS a nivel europeo (FP7), DRINKING WATER LIBRARY a nivel nacional (Convocatoria Retos-Colaboración 2015) y FEPS1305 (proyecto interno de Suez)-, han permitido dar un paso adelante en el camino para la resolución de las dos dificultades anteriormente citadas, con el objetivo de poder implementar los últimos avances tecnológicos surgidos del mundo clínico al ámbito de la Microbiología Ambiental.
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