Theoretical methods for measuring chemo-physical properties of nucleic acids during the radicalization of dna and the incidence of cancer

• Imanzadeh, Mehdi ^[1] ; Zare, Karim ^[1] ; Monajjemi, Majid ^[1] ; Shamel, Ali ^[1]
  1. [1] Islamic Azad University

     Islamic Azad University

     Irán

     
• Localización: Nexo Revista Científica, ISSN-e 1995-9516, Vol. 32, Nº. 1, 2019, págs. 1-12
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Métodos teóricos para medir las propiedades químico-físicas de los ácidos nucleicos durante la radicalización del adn y la incidencia del cáncer
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• Resumen
  • español

    Uno de los casos considerados para diagnosticar daños en el ADN es el diagnóstico de daños probables en el ADN contra agentes oxidantes, incluidos productos químicos oxidantes y diversos rayos incidentes que hacen que las bases en el ADN se oxiden y especialmente las bases G en la secuencia del ADN que se oxida más fácilmente que las otras bases. Por lo tanto, el propósito de este trabajo es proveer información relevante para la medición de las propiedades físico químicas de los ácidos nucleicos durante la radicalización del ADN y la incidencia de cáncer utilizando métodos teóricos. El objeto de esta investigación fue examinar la NBO de una cadena con secuencias de GG, CG, AA AG AC: AT CT GT TT seguidas de los niveles de energía y forma de LUMO orbital y HOMO obtenidos de los cálculos de Gauss para secuencias por encima de dos cadenas. Los resultados mostraron que el material genético de la forma B es la estructura más estable frente a los agentes físicos y químicos. Sólo la cantidad de población molecular y los niveles de vibración dinámica molecular y termoquímica molecular como la entalpía y la entropía son independientes de la temperatura. En adición a eso, la brecha entre las capas y el potencial y la energía necesarios para oxidar los componentes en las dos cadenas de ADN y su estructura óptima no cambiarán con la temperatura. Las condiciones óptimas en el ADN y sus enlaces son la temperatura de 37 ° C y el pH es de 7 a 8,7. EL ADN tiene la forma B y la tasa de protección física es la más alta.

  • English

    One of cases considered for diagnosing DNA damages is diagnosing DNA probable damages against oxidizing agents, including oxidizing chemicals and various incident rays which cause the bases in the DNA to be oxidized and especially bases G in the DNA sequence which is more easily oxidized than the other bases. Therefore, the main objective of this comprehensive survey is to provide relevant information on measure physical chemical properties of nucleic acids during DNA radicalization and incidence of cancer using theoretical methods. The aim of the present study is to examine the single-stranded NBO with sequences of GG, CG, AA AG AC: AT CT GT TT followed by the levels of energy and form of orbital LUMO and HOMO obtained from Gaussian computations for above double-stranded sequences. Our results showed that form B genetic material is the most stable structure against physical and chemical agents. Only the number of molecular population and the levels of molecular dynamic vibration and molecular thermochemistry such as enthalpie and entropie are temperature independent. In addition to this, the gap between the layers and the potential and energy needed to oxidize the components in the two strands of DNA and its optimum structure will not change with temperature. Optimum conditions on DNA and its bonds are the temperature of 37 ° C and pH is 7 to 8.7. DNA has form B and the rate of physical protection is the highest.