Introducción: los ensayos clínicos constituyen la herramienta fundamental para valorar la eficacia y la seguridad de nuevos medicamentos, es a partir del vínculo médico investigador, paciente y consentimiento informado donde se da por inicio la participación a diversas actividades que forman parte de los protocolos de ensayos clínicos. Objetivo: determinar el nivel de conocimiento de los médicos investigadores de dos países que participan en diferentes ensayos clínicos ante el consentimiento informado. Métodos: se utilizó encuesta validada aplicada a médicos investigadores de dos países, que se encontraban desarrollando ensayos clínicos. Resultados: de 91 médicos (peruanos y extranjeros), el 39.6% mostró un nivel de conocimiento alto, 38.5% nivel regular y 22% nivel bajo, observándose una diferencia de 1.1% para los valores alto a regular. Las especialidades médicas que participaron del estudio fueron: cardiología, oncología, oftalmología y reumatología. Se pudo determinar que existe relación entre el nivel de conocimiento sobre consentimiento informado con los años de experiencia en el campo de la investigación clínica, observándose altos niveles de conocimiento en aquellos que presentaban una experiencia ≥11 años siendo la especialidad de Oncología la que evidenció obtener el mejor resultado, seguido de los especialistas en Cardiología y Reumatología. Conclusión: hay diferencias entre las especialidades de los médicos investigadores de ensayos clínicos. El siguiente paso debería ser el adoptar medidas necesarias con los médicos investigadores de ensayos clínicos pudiendo ser considerada como parte de una revisión anual a cargo de los organismos locales (Comités de ética, Ministerio de Salud, entre otros).
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