Resumen de Características virológicas y diagnóstico del SARS-CoV-2

Jordi Reina Prieto, Pablo Arturo Fraile Ribot

• español

  El 31 de diciembre de 2019 se detectó en la ciudad de Wuhan (China) un brote de neumonía de etiología desconocida. Una semana después se aisló en estos pacientes un nuevo coronavirus, designado inicialmente como 2019-nCoV y posteriormente SARS-CoV-2. Este virus pertenece al género Coronavirus y subgénero Sarbecovirus (beta-coronavirus, beta-2b). Presenta un ge-noma ARN de una sola cadena de unos 30.000 nucleótidos y seis ORF. La principal proteína, tanto funcional (unión receptor ACE2 celular) como inmunogénica, es la denominada S o espícula, siendo la base para el diagnóstico y la futura vacuna. El SARS-CoV-2 tiene como reservorio natural a los murciélagos salvajes y como posible huésped intermedio se postula el pangolín. La proteína S del nuevo coronavirus presenta <75% de semejanza con la de los otros coronavirus conocidos pero una identidad del 93% con la procedente del coronavirus del murciélago (BatCoV RaTG13). El diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2 se realiza preferen-temente mediante una RT-PCR basada en los genes S (cribado), RpRd y N que le dan una elevada sensibilidad y especificidad. La serología puede ser útil es el diagnóstico de enfermedad y en los estudios de seroprevalencia.

• English

  On December 31, 2019, an outbreak of pneumonia of unknown etiology was detected in the city of Wuhan (China). A week later, a new coronavirus, initially designated as 2019-nCoV and later SARS-CoV-2, was isolated from these patients. This virus belongs to the genus Coronavirus and subgenus Sarbecovirus (beta-coronavirus, beta-2b). It has a single-stranded RNA genome of about 30,000 nucleotides and six ORFs. The main protein, both functional (cellular ACE2 receptor binding) and immunogenic, is the so-called S or spicule, being the basis for diagnosis and the future vaccine. SARS-CoV-2 has wild bats as its natural reservoir and the pangolin is postulated as a possible intermediate host. The S protein of the new coronavirus presents <75% similarity with that of the other known coronaviruses but 93% identity with that of the bat coronavirus (BatCoV RaTG13). The diagnosis of SARS-CoV-2 infection is preferably carried out by means of RT-PCR based on the S (screening), RpRd and N genes that give it high sensitivity and specificity. Serology can be useful in the diagnosis of disease and in seroprevalence studies.