Resumen de Caracterização molecular de Prosopis juliflora (Sw.) DC. por meio de marcadores moleculares e índices de similaridade genética
Messulan Rodrigues Meira, Luiz Henrique Tolentino Santos, Quirlian Queite Araújo Anjos, Brenda Emilly Ferreira Santos, Leonardo de Sousa Guimarães, Carlos Bernard Moreno Cerqueira Silva
- English
Prosopis juliflora (Sx.) DC., commonly known as algarroba, is an adapted tree species in Brazil with animal food value and environmental value in reforestation. However, little is known about its molecular genetic diversity. Therefore, the aim of our study was to use different similarity measures based on the genetic characterization of algarroba obtained through ISSR and RGA markers in naturalized individuals in southwestern Bahia. Young leaves of 36 algarroba individuals were collected in the municipality of Itapetinga, Bahia. DNA was extracted by the 10% SDS protocol and quantified by the absorbance ratio A260/A230 and A260/A280 nm. Ten pairs of RGA and 23 primers of ISSR were used for PCR, and the amplified products were electrophoresed on 2% agarose gels for 2 h. The genotyping results (binary matrix) were used to calculate the Jaccard, Simple Matching and Sorensen Dice similarity coefficients. Finally the UPGMA clustering, Tocher optimization and PCA were performed. We observed for ISSR and RGA 205 and 68 marks, respectively, with expected heterozygosity of 0.28 and 0.21; polymorphic information content was 91.71 and 0.17% and genetic distance 8.0 and 8.53, respectively. These findings contribute to our understanding of the wide distribution and adaptation of this species in reforested areas.
- português
Algaroba, Prosopis juliflora (Sx.) DC., é uma espécie arbórea adaptada no Brasil com valor alimentício animal e ambiental para reflorestamento. Porém pouco se sabe sobre sua diversidade genético-molecular. Portanto objetivou-se estudar diferentes índices de similaridade a partir de caracterizações genéticas da algaroba obtidas por meio dos marcadores ISSR e RGA em indivíduos naturalizados no sudoeste da Bahia. Folhas jovens de 36 indivíduos foram coletadas no município de Itapetinga, Bahia. O DNA foi extraído pelo método SDS 10% e quantificado pela razão de absorbância A260/A230 e A 260/A280 nm. Dez pares de RGA e 23 iniciadores ISSR foram utilizados para a reação de PCR, cujas reações foram submetidas à eletroforese em gel de agarose a 2% por 2 h. O resultado da genotipagem (matriz binária) foi utilizado para cálculo dos índices de similaridade de Jaccard, Simple Matching e Sorensen Dice. Por fim, foram realizados os agrupamentos UPGMA, otimização de Tocher e PCA. Foram observados 205 e 68 marcas polimórficas, com heterozigosidade esperada de 0,28 e 0,21; informação polimórfica de 91,71% e 0,17% e distância genética de 8,0 e 8,53 para ISSR e RGA, respectivamente. Essas informações contribuem para o entendimento da distribuição e adaptação da espécie em áreas reflorestadas.
