Canviant la forma de veure els mètodes QSAR: aplicació de la projecció hiperbòlica a la química mèdica

• Roger Estrada ^[1] ; Santi Nonell ^[1] ; Jordi Teixidó ^[1]
  1. [1] Universitat Ramon Llull

     Universitat Ramon Llull

     Barcelona, España

     
• Localización: Revista de la Societat Catalana de Química, ISSN-e 2013-9853, ISSN 1576-8961, Nº. 11, 2012, págs. 61-67
• Idioma: catalán
• Títulos paralelos:
  • Changing the way of viewing QSAR methods: the application of hyperbolic projection in medicinal chemistry
• Enlaces
  • Texto completo
• Resumen
  • català

    Els mètodes basats en lligands que permeten relacionar l’estructura molecular amb la predicció d’una propietat o activitat d’interès (QSAR/QSPR) són utilitzats en química mèdica per al disseny de fàrmacs amb unes propietats determinades. Els models obtinguts com a resultat acostumen a estar formats per un elevat nombre de variables que en dificulten la representació gràfica en l’espai euclidià. S’ha comprovat que el pas a un espai governat per una geometria hiperbòlica permet, mitjançant un canvi de mètrica, la representació d’espais multidimensionals sobre un espai de dues dimensions (en aquest cas, un disc de Poincaré). La projecció es realitza mitjançant l’optimització amb algorismes genètics de les coordenades de cada molècula en el disc, identificant aquelles que permeten mantenir la relació de semblança existent entre elles en l’espai original. Aquesta metodologia ha estat aplicada de forma complementària a altres mètodes de reducció dimensional per facilitar la selecció de les variables a emprar per a la predicció de la localització subcel·lular de fotosensibilitzadors.Paraules clau: Geometria hiperbòlica, disc de Poincaré, espais multidimensionals, QSPR, QSAR, teràpia fotodinàmica.

  • English

    Lligand-based methods used in medicinal chemistry permit mathematical relationships to be established between molecular structure and the prediction of a property or biological activity (QSPR/QSAR) in the design of drugs with specific characteristics. The resulting models are usually defined by a large number of variables, which complicates their graphical representation in Euclidean space. The use of hyperbolic geometry in the definition of space has been found to enable the representation of multidimensional points on a bidimensional space by changing the metric definition (in this case, using Poincaré’s disk model). The projection of multidimensional points is performed by optimising genetic algorithms to find the coordinates which maintain intramolecular similarity. This methodology has been applied with other dimensional reduction techniques to identify the most appropriate variables to be used in the prediction of the subcellular localization of photosensitizers.Keywords: Hyperbolic geometry, Poincaré’s disk model, multidimensional spaces, QSPR, QSAR, photodynamic therapy.