Human papillomavirus 13 L1 gene polimorphism: first report

• Cetina Cetz, Irvin Rodrigo ^[1] ; Conde Ferráez, Laura ^[1] ; Gómez Carballo, Jesús ^[1] ; Ayora Talavera, Guadalupe ^[1] ; González losa, María del Refugio ^[1]
  1. [1] Regional Research Center “Dr. Hideyo Noguchi”, Campus of Health Sciences, Autonomous Yucatan University. Mérida, Yucatán, México
• Localización: Revista Biomédica, ISSN-e 2007-8447, ISSN 0188-493X, Vol. 33, Nº. 3, 2022, págs. 96-104
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Polimorfismo del gen L1 del virus de papilloma humano 13: primer reporte
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• Resumen
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    Introducción. El virus de papilloma humano 13 (VPH-13) pertenece a los Alphapapillomavirus-10. Es un virus con tropismo por la mucosa oral relacionado filogenéticamente con otros papilomavirus humanos (6, 11, 44, 55 y 74). Es responsable de la Hiperplasia Epitelial Multifocal, patología oral benigna poco común, reportada principalment en grupos étnicos de América.

    Objetivo. Describir la variabilidad genética del gen L1 del virus del VPH-13.

    Material y Métodos. Se realizó un estudio retrospectivo que incluyó 50 muestras orales de pacientes con Hiperplasia Epitelial Multifocal, y 25 de portadores asintomáticos del VPH- 13, todos residentes del area Maya de México. Se amplificó y secuenció un segmento de 240 pb del gen L1 del VPH-13, que codifica para la proteína mayor de la cápside.

    Las secuencias fueron comparadas con las únicas dos secuencias de referencias disponibles. Se construyó el árbol filogenético utilizando el software PAUP* Resultados. Se identificaron ocho polimorfismos de un solo nucleótido, incluidos tres polimorfismos sinónimos y cinco no sinónimos. Según el árbol filogenético las variantes se agruparon en dos brazos.

    Conclusión. Éste es el primer reporte de la presencia de polimorfismos genéticos del VPH 13. Estos resultados son relevantes para futuras investigaciones con el objetivo de identificar linajes y sublinajes.

    Nuestro análisis in silico sugiere que los cambios de aminoácidos involucran estructuras directamente relacionadas con el reconocimiento de antígenos, lo que requiere de mas investigaciones

  • English

    Introduction. Human papillomavirus 13 (HPV-13) belonging to Alphapapillomavirus-10 species, is an oral mucosotropic virus phylogenetically related to other human papillomavirus (6, 11, 44, 55 and 74). It causes Multifocal Epithelial Hyperplasia, an uncommon benign oral disease reported mainly amongst ethnic groups from America.

    Objective. To describe the genetic variability of the HPV-13 L1 gene.

    Material and Methods. A retrospective study including 50 oral samples from patients with Multifocal Epithelial Hyperplasia, and 25 samples from asymptomatic carriers of HPV-13, all subjects living in Mayan area of Mexico.

    A fragment 240 bp corresponding to the HPV 13L1 gene, which encodes the major capsid protein was amplified, sequenced, and compared with the only two reference sequences of HPV-13 available. A phylogenetic tree was constructed using PAUP* software.

    Results. Eight single nucleotide polymorphisms were identified including three synonymous polymorphism and five non-synonymous. According to the phylogenetic tree, the variants were grouped in two branches.

    Conclusion. This is the first report for the presence of genetic polymorphisms of HPV-13. These results are relevant for future research aiming to identify lineages and sub lineages. Our in-silico analysis suggests that the amino acid changes would be involving structures directly related to antigen recognition, which requires further investigations