Exploring bovine fecal bacterial microbiota in the Mapimi Biosphere Reserve, Northern Mexico

• Irene Pacheco-Torres ^[1] ; Cristina García de la Peña ; César Alberto Meza Herrera ; Felipe Vaca Paniagua ; Clara Díaz Velásquez ; Claudia Fabiola Méndez-Catalá ^[2] ; L. Antonio Tarango Arámbula ; Luis M. Valenzuela Núñez ; Jesús Vásquez Arroyo
  1. [1] Universidad Autónoma Chapingo

     Universidad Autónoma Chapingo

     México

     
  2. [2] Facultad de Estudios Superiores Iztacala
• Localización: Revista Mexicana de Ciencias Pecuarias, ISSN 2007-1124, ISSN-e 2448-6698, Vol. 13, Nº. 4, 2022, págs. 910-927
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Explorando la microbiota bacteriana fecal bovina en la Reserva de la Biosfera de Mapimí, norte de México
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  • Texto completo
• Resumen
  • español

    En México la información sobre la microbiota fecal bovina (Bos taurus) es escasa. El presente estudio describe la diversidad y abundancia de bacterias en muestras fecales de bovinos en pastizales, recolectadas en la Reserva de la Biosfera de Mapimí en la parte central del desierto chihuahuense. Las muestras fecales se analizaron mediante secuenciación masiva de siguiente generación de alto rendimiento utilizando la V3-V4 del ARNr 16S en Miseq de Illumina. Se identificaron un total de 17 filos, 24 clases, 33 órdenes, 50 familias, 281 géneros y 297 especies. Firmicutes y Verrucomicrobia fueron los filos más abundantes. Los géneros más abundantes fueron Sporobacter, PAC000748_g (géneros de la familia Ruminococcaceae) y Eubacterium_g23. Se registraron tres géneros (Clostridium, Corynebacterium y Fusobacterium) y una especie (Campylobacter fetus) de bacterias bovinas potencialmente patógenas. Esta información representa una línea base bacteriológica para monitorear el estado de salud intestinal de bovinos en pastoreo y para rastrear posibles interacciones con la microbiota fecal de la fauna nativa itinerante del área.

  • English

    In Mexico, information on the bovine fecal microbiota (Bos taurus) is scarce. The present study describes the diversity and abundance of bacteria in fecal samples from rangeland bovines, collected in the Mapimi Biosphere Reserve in the central part of the Chihuahuan desert. Fecal samples were analysed using high-throughput next generation massive sequencing using V3-V4 16S rRNA on Illumina Miseq. A total of 17 phyla, 24 classes, 33 orders, 50 families, 281 genera, and 297 species were identified. Firmicutes and Verrucomicrobia were the most abundant phyla. The most abundant genera were Sporobacter, PAC000748_g (genera into the Ruminococcaceae family) and Eubacterium_g23. Three genera (Clostridium, Corynebacterium and Fusobacterium) and one species (Campylobacter fetus) potentially pathogenic bovine bacteria were registered. This information represents a bacteriological baseline for monitoring the grazing bovine intestinal health status, and to trace possible interactions with the fecal microbiota of native roaming wildlife in the area.