Alteraciones de la expresión génica en la infección por SARS-COV-2 en distintos modelos de estudio

• M. Arroyo Varela ^[1] ; B. Delgado Martín ^[2] ; R. Larrosa Jiménez ^[2] ; R. Bautista Moreno ^[2]
  1. [1] Hospital Regional Universitario de Málaga

     Hospital Regional Universitario de Málaga

     Málaga, España

     
  2. [2] Universidad de Málaga

     Universidad de Málaga

     Málaga, España

     
• Localización: Revista española de patología torácica, ISSN-e 1889-7347, Vol. 34, Nº. 4, 2022, págs. 200-208
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Alterations of gene expression in SARS-COV-2 infection in different study models
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    Resumen abreviado: Se han usado tres modelos de estudio distintos para estudiar los perfiles de expresión génica producido por el SARS-CoV-2: cultivos de células epiteliales bronquiales, organoides de las vías respiratorias y muestras obtenidas de autopsias en pacientes, con y sin infección por SARS-CoV-2.Fundamento: La pandemia por SARS-CoV-2 ha supuesto un auténtico reto para el mundo científico debido a la rápida transmisión y elevada mortalidad que produce este nuevo coronavirus. La enfermedad asociada se ha denominado COVID-19 y abarca desde casos asintomáticos hasta graves que evolucionan rápidamente a síndrome de distrés respiratorio agudo, alteraciones multisistémicas y la muerte. La comunidad científica ha aunado esfuerzos para tratar de conocer mejor el proceso fisiopatológico de la infección con la intención de combatir de forma más eficaz la enfermedad. En este trabajo presentamos un estudio para conocer las alteraciones de la expresión génica provocadas por la infección.Métodos: Se han usado tres modelos de estudio distintos: cultivos de células epiteliales bronquiales, organoides de las vías respiratorias y muestras obtenidas de autopsias en pacientes, con y sin infección por SARS-CoV-2. Se han analizado los perfiles de expresión alterados por la infección en cada modelo, así como las categorías funcionales enriquecidas.Resultados: Solo 4 genes son comunes en los tres tipos de modelos de estudio, siendo el modelo de autopsias el más dispar. Dentro de los genes comunes en los modelos de cultivo celular y organoide de pulmón encontramos funciones relacionadas con procesos inflamatorios. Conclusiones: Los estudios in vitro son un buen modelo para tener una foto fija de las alteraciones en los patrones de infección, mientras que las autopsias no son un buen modelo debido al sesgo provocado por la necrosis.

  • English

    Short summary: Three different study models have been used to study the gene expression profiles produced by SARS-CoV-2: bronchial epithelial cell cultures, airway organoids, and autopsy samples from patients with and without SARS-infection. CoV-2.Basis: The SARS-CoV-2 pandemic has been a real challenge for the scientific world due to the rapid transmission and high mortality caused by this new coronavirus. The associated disease has been named COVID-19 and ranges from asymptomatic to severe cases that rapidly progress to acute respiratory distress syndrome, multisystem disorders, and death. The scientific community has joined efforts to try to better understand the pathophysiological process of the infection with the intention of combating the disease more effectively. In this work we present a study to determine the alterations in gene expression caused by the infection.Methods: Three different study models have been used: bronchial epithelial cell cultures, airway organoids, and samples obtained from autopsies in patients with and without SARS-CoV-2 infection. The expression profiles altered by the infection in each model have been analyzed, as well as the functional categories enriched.Results: Only 4 genes are common in the three types of study models, the autopsy model being the most disparate. Within the common genes in cell and organoid culture models of the lung, we find functions related to inflammatory processes.Conclusions: In vitro studies are a good model to have a snapshot of alterations in infection patterns, while autopsies are not a good model due to bias caused by necrosis.