As bactérias intestinais formam um ecossistema complexo e exercem enorme importância na manutenção da homeostase do hospedeiro. Por vezes, intervenções graves podem levar à degradação deste ecossistema, como por exemplo, através de doenças e/ou pelo uso de antibióticos. Este relato tem por objetivo demonstrar o uso do Transplante de Microbiota Fecal (TMF) como terapia adjuvante em dois casos de diarreia crônica refratária a terapia convencional em dois caninos com menos de um ano de idade. Após terem apresentado gastrenterite hemorrágica secundária a parvovirose, apesar da melhora clínica e alta, ambos permaneceram com fezes pastosas e dificuldade de ganho de peso. Foram tratados com antimicrobianos sem apresentar melhora, a diarreia cessou após suspensão das medicações e instituição do TMF. Conclui-se que, assim como em outras espécies, o TMF pode ter auxiliado na resolução dos sinais clínicos dos pacientes e pode ser utilizado como adjuvante na terapia de suporte convencional no tratamento de diarreias crônicas em cães.
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