Variabilitat i seqüenciació massiva de virus. El SARS-CoV-2 com a exemple

• Cristina Andrés ^[1] ; David Tabernero ^[2] ; Tomás Pumarola ^[1] ; Andrés Antón ^[1] ; Josep Quer ^[2]
  1. [1] Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR)
  2. [2] Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd), Instituto de Salud Carlos III
• Localización: Treballs de la Societat Catalana de Biologia, ISSN 0212-3037, ISSN-e 2013-9802, Nº. 72, 2022, págs. 51-59
• Idioma: catalán
• Títulos paralelos:
  • Variability and massive sequencing of viruses. SARS-CoV-2 as an example
• Enlaces
  • Texto completo
• Resumen
  • català

    Una de les coses que hem après en els darrers dos anys, concretament amb la pandèmia del SARS-CoV-2, és que no podem emmurallar els virus per a evitar-ne la propagació, i la manera més eficaç de lluitar-hi en contra és amb una detecció i una caracterització genètica ràpides. Les pandèmies causades per virus han ocorregut, n’estem patint una i tard o d’hora en tornarem a patir. En els darrers anys, el risc de noves pandèmies s’ha incrementat degut a factors que les afavoreixen, com ara la destrucció d’espais naturals, la facilitat per a fer viatges de llarga distància en qüestió d’hores, el canvi climàtic i l’augment de concentracions humanes i activitats socials en un món cada vegada més globalitzat. En aquest sentit, la seqüenciació massiva o seqüenciació de nova generació (NGS, next generation sequencing) ha demostrat ser una eina molt poderosa que ha ajudat en el diagnòstic, en el desenvolupament de vacunes, en la identificació i el seguiment de variants i a conèixer millor la biologia del virus. La pandèmia del SARS-CoV-2 ha permès demostrar la utilitat de l’NGS i la necessitat de reforçar la xarxa de laboratoris de seqüenciació. Com més preparats estiguem, més ràpida i eficaç serà la resposta contra una possible amenaça.

  • English

    One of the things that we have learned in the last two years, specifically from the SARS-CoV-2 pandemic, is that we cannot wall in viruses to prevent their propagation, and that the most effective way to combat them is to ensure their rapid detection and genetic characterisation. Pandemics caused by viruses have broken out in the past, we are currently experiencing such a pandemic, and sooner or later we will surely be struck by another one. The risk of new pandemics has grown in recent years, due to factors favouring their appearance such as the destruction of natural areas, the ease of long-distance travel in a matter of hours, climate change, and the increase of human concentrations and social activities in a constantly more globalised world. In this respect, massive or next-generation sequencing (NGS) has proven to be a very powerful tool that has been of help in diagnosis and in the development of vaccines, the identification and monitoring of variants, and the study of the biology of the virus. The SARS-CoV-2 pandemic has allowed to demonstrate the utility of NGS as well as the need to strengthen the network of sequencing laboratories. The better we are prepared, the quicker and more effective will be our response to a possible threat.