Comparison of two isothermal methods for SARS-COV-2 screening in Callao, Peru

• Cassa-Loaiza, W. ^[1] ; Vásquez-Velásquez, C. ^[2] ; Gonzales, G.F. ^[2] ; Velasquez-Medrano, C. ^[3] ; Fernandez-Delgado, K. ^[3] ; Alvarez-Huambachano, K. ^[4] ; Gamboa-Serpa, H. ^[4] ; Fano-Sizgorich, D. ^[2]
  1. [1] Universidad Privada San Juan Bautista

     Universidad Privada San Juan Bautista

     Perú

     
  2. [2] Universidad Peruana Cayetano Heredia

     Universidad Peruana Cayetano Heredia

     Perú

     
  3. [3] Dirección de Laboratorio de Salud Pública, Dirección Regional de Salud, Callao, Perú
  4. [4] Dirección Regional de Salud del Callao, Perú

  Mostrar afiliaciones +
• Localización: Acta Médica Peruana, ISSN-e 1018-8800, ISSN 1728-5917, Vol. 39, Nº. 4, 2022 (Ejemplar dedicado a: OCTUBRE - DICIEMBRE), págs. 376-380
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Comparación de dos métodos isotérmicos para la detección de SARS-COV-2 en Callao, Perú
• Enlaces
  • Texto completo (pdf)
• Resumen
  • español

    Objetivo: Comparar las técnicas de cribado molecular isotérmico CPA y RT-LAMP, frente a la prueba de referencia, la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa de transcripción inversa (RT-qPCR), y determinar su concordancia. Materiales y métodos: Estudio comparativo de casos y controles emparejados. Para la evaluación del método CPA se utilizaron 70 casos y 130 controles, mientras que para la RT-LAMP se utilizaron 30 casos y 70 controles. Se calcularon la sensibilidad y la especificidad de ambas pruebas. Posteriormente, se calculó el índice Kappa corregido por sesgo mediante un nuevo muestreo. Resultados: Ambas técnicas presentan valores adecuados y equivalentes de sensibilidad (RT-LAMP: 82,8 %, CPA: 83 %) y especificidad (RT-LAMP y CPA: 91,5 %), así como una alta concordancia (88 %), y un índice Kappa (0,72). Conclusiones: Ambas técnicas de cribado molecular isotérmico son adecuadas para el cribado del SARS-CoV-2, con una sensibilidad y especificidad similares

  • English

    Objective: To compare the isothermal molecular screening techniques CPA and RT-LAMP, against the gold standard test, reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), and to determine its agreement. Materials and Methods: Paired comparative case-control study. For the evaluation of the CPA method, 70 cases and 130 controls were used, while for RT-LAMP, 30 cases and 70 controls were used. The sensitivity and specificity of both tests were calculated. Subsequently, the bias-corrected Kappa index was calculated by resampling. Results: Both techniques have adequate and equivalent values of sensitivity (RT-LAMP: 82.8%, CPA: 83%) and specificity (RT-LAMP and CPA: 91.5%), as well as a high concordance (88%), and Kappa-index (0.72). Conclusion: Both isothermal molecular screening techniques are suitable for SARS-CoV-2 screening, with a similar sensitivity and specificity