Mariana José Fernandez Pittol, Izaskun Alejo Cancho, Elisa Rubio García, Celia Cardozo, Pedro Puerta Alcalde, Estela Moreno García, Nicole Garcia Pouton, Miriam Garrido, Miriam Villanueva, Ana Alastruey-Izquierdo, Cristina Pitart, Carolina García Vidal, Francesc Marco
Las especies crípticas de Aspegillus son raras, estos microorganismos suelen ser más resistentes a las terapias antimicóticas comunes. Por lo tanto, es importante una identificación correcta al evaluar el impacto de dichas especies en la aspergilosis. Objetivos Nuestro objetivo fue describir la frecuencia, las características clínicas y microbiológicas y la evolución de los casos de aspergilosis por especies crípticas en un hospital de tercer nivel. Métodos Identificamos retrospectivamente todos los casos microbiológicamente documentados de aspergilosis entre enero de 2013 y diciembre de 2018. La identificación definitiva de especies de aislamientos clínicamente significativos se logró mediante métodos de secuenciación. Los productos de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) fueron secuenciados y los resultados obtenidos fueron comparados con secuencias depositadas en GenBank. Las pruebas de susceptibilidad antifúngica se realizaron utilizando el panel Sensititre® YeastOne®. Resultados Se recuperaron un total de 679 aislamientos de Aspergillus de 489 pacientes, de los cuales 109 fueron clínicamente relevantes. Diez aislados (9,2%) fueron identificados como especies crípticas: Aspergillus arcoverdensis (2), Aspergillus lentulus (2), Aspergillus ellipticus (2), Aspergillus alliaceus (1), Aspergillus nomius (1), Aspergillus tubingensis (1) y Aspergillus montevidensis(1). La mayoría de los pacientes ya sufrían algún tipo de inmunosupresión. La mitad de estos pacientes habían requerido cuidados intensivos antes de que apareciera la infección y la mayoría tenía una infección pulmonar. La mortalidad a los 100 días de seguimiento fue del 40%. Se realizaron pruebas de susceptibilidad antifúngica en tres de los aislamientos ( A. arcoverdensis , A. tubingensis y A. nomius ), que mostraron concentraciones inhibitorias mínimas (MIC) altas para azoles y anfotericina B. Conclusiones La frecuencia de especies crípticas en nuestro centro fue del 9,2%. La mayoría de los pacientes tenían algún grado de inmunosupresión y la tasa de mortalidad fue del 40%.
The cryptic Aspegillus species are rare, these microorganisms are usually more resistant to common antifungal therapies. Therefore, a correct identification is important when evaluating the impact of such species in aspergillosis. Aims We aimed to describe the frequency, clinical and microbiological characteristics, and the outcomes of those cases of aspergillosis caused by cryptic species in a tertiary hospital. Methods We retrospectively identified all microbiologically documented cases of aspergillosis between January 2013 and December 2018. Definitive species identification of clinically significant isolates was achieved via sequencing methods. The polymerase chain reaction (PCR) products were sequenced, and the results obtained were compared to sequences deposited in GenBank. Antifungal susceptibility testing was performed using the Sensititre® YeastOne® panel. Results A total of 679 Aspergillus isolates were recovered from 489 patients, of which 109 were clinically relevant. Ten (9.2%) isolates were identified as cryptic species: Aspergillus arcoverdensis (2), Aspergillus lentulus (2), Aspergillus ellipticus (2), Aspergillus alliaceus (1), Aspergillus nomius (1), Aspergillus tubingensis (1) and Aspergillus montevidensis (1). Most patients already suffered some type of immunosuppression. Half of these patients had required intensive care before the infection showed up, and most of them had a pulmonary infection. Mortality at the 100-day follow-up was 40%. Antifungal susceptibility testing was performed on three of the isolates (A. arcoverdensis, A. tubingensis and A. nomius), which showed high minimum inhibitory concentrations (MIC) for azoles and amphotericin B. Conclusions The frequency of cryptic species in our centre was 9.2%. Most patients had some degree of immunosuppression, and the mortality rate was 40%.
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