Metabarcoding: una herramienta prometedora para el estudio de la ecología trófica de peces mexicanos

• Víctor Julio Piñeros ^[1] ; Nancy Calderón-Cortés ^[2]
  1. [1] Universidad de Guadalajara

     Universidad de Guadalajara

     México

     
  2. [2] Universidad Nacional Autónoma de México

     Universidad Nacional Autónoma de México

     México

     
• Localización: Revista Mexicana de Biodiversidad, ISSN 1870-3453, ISSN-e 2007-8706, Vol. 94, Nº. 2, 2023
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Metabarcoding: a promising tool for studying the trophic ecology of Mexican fish
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• Resumen
  • español

    El papel de los peces en la dinámica trófica de los ecosistemas acuáticos se ha estudiado usando diferentes métodos que permiten determinar su dieta y posición trófica (inspección visual del contenido estomacal y heces, isótopos estables, secuenciación de ADN). Con los avances tecnológicos en la secuenciación de alto rendimiento del ADN, el uso del método de metabarcoding se ha incrementado en los últimos años, demostrando tener mayor precisión y alcance taxonómico que otros métodos, además de que permite el análisis simultáneo de un mayor número de muestras en un menor tiempo. En esta revisión, se describen los pasos del método de metabarcoding, discutiendo sus ventajas y limitaciones, así como las alternativas experimentales y analíticas propuestas para atender dichas limitaciones. Además, se presenta una síntesis del estado del conocimiento del método de metabarcoding aplicado al análisis de la ecología trófica de peces para entender los alcances y las limitaciones de este método en México.

  • English

    The role of fishes in trophic dynamics in the aquatic ecosystems has been studied by analyzing fish diet and trophic position in ecosystems using diverse methods (e.g., visual inspection of stomach contents and feces, stable isotopes, DNA sequencing). Thanks to the advances in high-throughput DNA sequencing technology, the use of the metabarcoding method has increased in recent years, proving to have greater precision and taxonomic scope than other methods, and allowing the analysis of a larger number of samples simultaneously in less time. This review describes the metabarcoding method, discusses its advantages and limitations, and presents experimental and analytical alternatives to address such limitations. Additionally, we provide a synthesis of the current state of knowledge of the metabarcoding method applied to the analysis of the trophic fish ecology to understand the scope and limitations of using this method in Mexico.