Resumen de Diseño in silico de primers para el gen GSTM1 en diagnóstico de Cáncer de Pulmón

Kevin Joel Guevara Guevara, Luis Felipe Varela Polit, Daniel Alfonso Cabrera Valle, Cristian Fernando Galarza Galarza

• español

  El cáncer de pulmón es una de las enfermedades oncológicas más prevalentes y mortales en todo el mundo. A medida que avanzamos en la comprensión de los mecanismos subyacentes de esta enfermedad, es evidente que la detección temprana y precisa es crucial para brindar el tratamiento efectivo.

  La familia de enzimas de transferencia de glutatión (GST) está involucrada en el metabolismo de una amplia variedad de carcinógenos, incluyendo aquellos que están asociados con el cáncer de pulmón. El gen GST1 (glutatión S-transferasa 1) es miembros de esta familia, y su expresión se ha relacionado con el riesgo de desarrollar cáncer de pulmón.

  Los primers in silico son secuencias cortas de ADN que se diseñan para unirse y amplificar regiones específicas de un gen. El objetivo del presente estudio fue diseñar primers para amplificar de forma precisa la sección ubicada entre el exón 5 y 7 donde se identificó un polimorfismo de nucleótido único (SNP), cuyos alelos generan susceptibilidad para desarrollar cáncer de pulmón.

  Los primers fueron diseñados empleando Primer3Plus y Primer-BLAST y analizados con OligoAnalyzer. De los 10 pares de primers diseñados, seleccionamos a los dos mejores de acuerdo con el tamaño del amplicón (148 y 155 pb) y la tendencia a formar dímeros. Con el fin de validar los primers diseñados se realizaron pruebas de PCR in silico mediante UGENE comprobando que el diseño de los primers fue exitoso. Se concluyó que fue posible diseñar y validar primers in silico específicos para el gen GTS1.

• English

  Lung cancer is one of the most prevalent and deadly cancer diseases worldwide. As we progress in understanding the underlying mechanisms of this disease, it is clear that early and accurate detection is crucial to providing effective treatment.

  The glutathione transfer (GST) family of enzymes is involved in the metabolism of a wide variety of carcinogens, including those that are associated with lung cancer. The GST1 gene (glutathione S-transferase 1) is a member of this family, and its expression has been linked to the risk of developing lung cancer.

  In silico primers are short DNA sequences that are designed to bind to and amplify specific regions of a gene. The objective of this study was to design primers to accurately amplify the section located between exon 5 and 7 where a single nucleotide polymorphism (SNP) was identified, whose alleles generate susceptibility to develop lung cancer.

  Primers were designed using Primer3Plus and Primer-BLAST and analyzed with OligoAnalyzer.

  Of the 10 primer pairs designed, we selected the best two according to the size of the amplicon (148 and 155 bp) and the tendency to form dimers. In order to validate the designed primers, in silico PCR tests were carried out using UGENE, verifying that the design of the primers was successful. It was concluded that it was possible to design and validate specific in silico primers for the GTS1 gene.