Resumen de Assessing genetic structuring for endangered "Chelonia mydas" (Testudines: Cheloniidae) in southwest Cuba using microsatellites

Luis Javier Madrigal Roca, Julia Azanza Ricardo, Georgina Espinosa López, Ken Oyama, F. Alberto Abreu Grobois, Omar Chassin Noria

• español

  La comprensión de la estructura genética poblacional de las especies es esencial para la determinación de las posibles unidades de manejo (UM) y con ello su conservación y/o explotación sostenible. Chelonia mydas es reconocida como una tortuga filopátrida en peligro de extinción. El objetivo de este trabajo es describir la estructura poblacional de la tortuga verde en el suroccidente de Cuba mediante enfoques analíticos tradicionales y métodos de asignación. Las recolectas se realizaron entre los años 1998 y 2007 en cinco playas del suroccidente cubano. Fueron amplificados siete loci de microsatélites de 149 individuos y se calcularon parámetros de variabilidad. La estructura poblacional fue inferida mediante el uso de estadísticos F de Wright, Análisis de Varianza Molecular (AMOVA) y algoritmos de asignación poblacional basados en análisis bayesianos (STRUCTURE) y en factorización de matrices no negativas poco densas (implementado en R). La mayoría de los loci no se encontraron en equilibrio de Hardy-Weinberg y varios de estos presentaron desequilibrio de ligamiento. El AMOVA y los estadísticos de diferenciación sugieren presencia de estructura al nivel geográfico analizado. El mayor valor de ΔK y el menor valor de entropía cruzada se alcanzaron para K = 2, resultado que propone que en el suroccidente de Cuba existe el aporte de dos poblaciones ancestrales de Chelonia mydas. Los estimados de migración relativa indican un intercambio genético activo entre colonias de anidación del suroccidente cubano. 

• English

  Understanding the population genetic structure of the species is essential for determining the possible management units (UM) and their conservation and/or sustainable exploitation with it. Chelonia mydas is recognized as an endangered philopatric turtle. This work aims to describe the population structure of the green turtle in southwestern Cuba through traditional analytical approaches and allocation methods. The collections were made between 1998 and 2007 on five beaches in the Cuban southwest. Seven microsatellite loci from 149 individuals were amplified and genetic variability parameters were calculated. The population structure was inferred through the use of Wright's F, Analysis of Molecular Variance (AMOVA), and population assignment algorithms based on Bayesian analysis (STRUCTURE) and factorization of sparse non-negative matrices (implemented in R). Most of the loci were not in Hardy-Weinberg equilibrium, and several presented linkage disequilibrium. The AMOVA and differentiation statistics suggest the presence of structure at the geographical level analyzed. The highest value of ΔK and the lowest value of cross-entropy were reached for K = 2, a result that suggests that in southwestern Cuba there is the contribution of two ancestral populations of Chelonia mydas. Relative migration estimates indicate active genetic exchange between nesting colonies in southwestern Cuba.