Diferencias genéticas y estructura de poblaciones de Capsicum spp. Con secuencias simples repetidas (SSRs)
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Yasmín Araceli Gálvez-Muñoz [1] ; María Esther Cea-Migenes [2] ; Régulo Ruíz Salazar [3] ; Guillermo Castañón-Nájera [1] ; Luis Latournerie-Moreno [5] ; Moisés Ramírez-Meraz [4]
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[1] Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
Universidad Juárez Autónoma de Tabasco
México
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[2] Universidad Agraria de La Habana
Universidad Agraria de La Habana
Cuba
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[3] Universidad Autónoma de Tamaulipas
Universidad Autónoma de Tamaulipas
México
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[4] Instituto Nacional de Investigaciones Forestales Agrícolas y Pecuarias
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales Agrícolas y Pecuarias
México
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[5] Instituto Tecnológico de México. Conkal, Yucatán, México
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- Localización: Bioagro, ISSN 1316-3361, ISSN-e 2521-9693, Vol. 36, Nº. 1, 2024, págs. 27-36
- Idioma: español
- Títulos paralelos:
- Genetic differences and population structure of Capsicum spp. populations with simple sequences repeat markers (SSRs)
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Resumen
- español
Entre las Solanáceas, Capsicum spp. es un género de hortalizas muy importante a nivel mundial, y cultivada extensamente en México. El objetivo del trabajo fue conocer la relación, diversidad y estructura genética de 14 poblaciones de Capsicum spp. (seis del estado de Tabasco y cinco de Tamaulipas, México, y tres de Cuba). Los cuatro oligonucleótidos identificaron 202 alelos, 38 de ellos fueron polimórficos. El mayor número de alelos (65) los amplificó el oligo HpmsCaSIG19 y Hpms1-274 detectó el menor número de alelos (35), la media de alelos fue de 50,5. La estructura genética de las poblaciones se estimó con los índices de fijación F. El valor de la diversidad entre regiones (PhiRT) fue 0,264, lo que significa que las poblaciones presentaron 73,6% de variación entre ellas. Se encontró alta diversidad entre subpoblaciones dentro de regiones (PhiPR=0,412). El PhiPT (análogo del FST)=0,567, puede interpretarse como alta diferenciación en las frecuencias génicas de las poblaciones evaluadas. El análisis clúster clasificó a las 14 poblaciones a una distancia de 11 en cinco grupos. Los clústeres I y III fueron formados por cuatro poblaciones cada uno, mientras que dos poblaciones por cluster se observaron en el clúster II, IV y V. En este análisis, la población Cachucha (Cach) de Cuba no se relacionó con las retrocruzas Habanero x Amashito (RCHaAm) y Garbanzo x Habanero (RCGaHa), tampoco a la población Habanero de Tabasco, México
- English
In the Solanaceae family, Capsicum spp. is a worldwide important vegetable genus, and widely cultivated in Mexico. The objective of this research was to know the genetic relation, genetic diversity, and genetic structure of fourteen populations of Capsicum spp. (six from Tabasco, five from Tamaulipas, Mexico, and three from Cuba). The four oligonucleotides identified 202 alleles, 38 of them were polymorphics. The majority of alleles (65) were amplified by oligo HpmsCaSIG19, and Hpms1-274 detected a small amount of alleles (35); the average of alleles was 50,5. The genetic structure of the population was estimated with the F fixation indices. The value of the diversity between regions (PhiRT) was 0,264, this means that the populations presented 73,6% of variation between them. High diversity was found among subpopulations and inside regions (PhiPR=0,412). The PhiPT (analog of FST)=0,567, can be interpreted as high differentiation in the genics frequency of the populations that were evaluated. The cluster analysis classified the fourteen populations at a distance of 11 in five groups; the clusters I and III were formed by four populations on each one, while, two populations per cluster were observed in the clusters II, IV, and V. In this analysis, the population Cachucha of Cuba was not related with the backcrosses Habanero x Amashito (RCHaAm) and Garbanzo x Habanero (RCGaHa), and it was not related to the Habanero population of Tabasco Mexico
- español
