Molecular characterization of Iranian dromedaries using microsatellite markers

• Autores: Mohammadreza Mohammadabadi, Mehrdad Ghasemi Meymandi, Mahdieh Montazen, Volodymyr Afanasenko, Oleksandr Kalashnyk
• Localización: Acta Agronómica, ISSN-e 2323-0118, ISSN 0120-2812, Vol. 69, Nº. 4, 2020, págs. 321-330
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Caracterización molecular de dromedarios iraníes usando marcadores microsatélites
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    Considerando la importancia de mantener la diversidad genética en los animales nativos, este estudio se realizó para analizar la diversidad genética en poblaciones de dromedarios en el norte de la provincia de Kerman, Irán, utilizando ocho marcadores microsatélites autosómicos. Se recolectaron 81 muestras de sangre de cinco poblaciones diferentes y se extrajo el ADN. El número de alelos más alto y más bajo y los alelos efectivos se mostraron en YWLL08 (21 y 4) y VOLP32 (14,97 y 3,11), respectivamente. La heterocigosidad esperada varió de 0,778 en la población de Sahra-e Jahad a 0,847 en la población de Nogh. La prueba de equilibrio de Hardy- Weinberg mostró desviaciones significativas en la mayoría de los loci. El valor medio de FST multilocus (0,057) sugirió que la diferenciación es moderada entre poblaciones. De la diversidad genética total, solo el 6% se debió a diferenciación entre poblaciones, mientras que el 94% restante correspondió a diferencias entre individuos dentro de cada población. Los resultados del estudio actual indicaron que las poblaciones de Camelus dromedarius en el norte de la provincia de Kerman tienen una variación genética relativamente alta y los datos podrían ser útiles para diseñar las estrategias de reproducción y conservación. El grado de variabilidad demostrado implica que las poblaciones estudiadas son ricos reservorios de diversidad genética que deben ser preservados. Una dirección futura de nuestro estudio puede ser estudiar todas las poblaciones de Camelus dromedarius iraníes para evaluar mejor el nivel de endogamia y establecer las estrategias de conservación adecuadas destinadas a evitar pérdidas de diversidad genética.

  • English

    Considering the importance of maintaining the genetic diversity in native animals, this study conducted to analyse genetic diversity in dromedary populations in the north of Kerman province, Iran, using eight autosomal microsatellite markers. Eighty-one blood samples were collected from five different populations and DNA was extracted. The highest and the lowest alíele number and effective alíeles were shown in YWLL08 (21 and 4) and VOLP32 (14.97 and 3.11), respectively. The expected heterozygosity varied from 0.778 in Sahra-e Jahad population to 0.847 in Nogh population. The test for Hardy-Weinberg equilibrium showed significant deviations in most loci. The mean multilocus Fst value (0.057) suggested that differentiation is modérate between populations. From total genetic diversity, only 6% were due to differentiation among populations, while the remaining 94% corresponded to differences among individuáis within each population. The results of the current study indicated that the Camelus dromedarius populations in the north of Kerman province have a relativity high genetic variation and the data could be useful for designing the breeding strategies and conservation. The degree of variability demonstrated implies that studied populations are rich reservoirs of genetic diversity that must be preserved. A future direction to our study can be studying all of the Iranian Camelus dromedarius populations to better evaluate the level of inbreeding and establish the appropriate conservation strategies aimed to avoid losses of genetic diversity.