Caracterización molecular y filogenética de cepas del virus de la enfermedad de Newcastle, aislado de zonas rurales del sur del Ecuador

• Muñoz-Chamba, Willan ^[1] ; Villacís Rivas, Gustavo ^[2]
  1. [1] Universidad Estatal de Guayaquil
  2. [2] Universidad Nacional de Loja
• Localización: CEDAMAZ, ISSN-e 1390-5902, ISSN 1390-5880, Vol. 7, Nº. 1, 2017
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Molecular characterization and phylogenetic of newcastle disease virus strains, isolated from rural areas of Southern Ecuador
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    El virus de la enfermedad de Newcastle es un paramyxovirus aviar altamente contagioso y el principal agente devastador de aves de corral, causando pérdidas económicas en la industria avícola alrededor del mundo. En esta investigación se caracterizaron molecularmente ocho secuencias parciales del gen de la proteína de Fusión y tres secuencias completas del gen de la proteína hemaglutinina-neuraminidasa de aislados del virus presentes en gallinas criollas en la región sur del Ecuador en el año 2014 de aves de traspatio no vacunadas. Dichas secuencias se compararon con otras secuencias de virus de la enfermedad Newcastle, representando diferentes genotipos del virus y subgenotipos desde diferentes regiones del mundo. Todos los virus mostraron la secuencia de aminoácidos 112GRQGR-L117 en el extremo terminal C de la proteína F2 y mostraron Leucina en el extremo terminal N de la proteína F1. Estas secuencias nos permitieron determinar que estos virus pertenecían a un tipo de virus lentogénico. El análisis filogenético de la región parcial del gen F y proteína HN demostró que la mayoría de los virus aislados en esta región del Ecuador estaban estrechamente relacionados con cepas del genotipo II de la clase II, consistente con la secuencia de vacunas de virus vivos lentogénicos, La Sota y B1. La caracterización molecular y el estudio filogenético de los genes de la proteína F y HN podrían usarse confiablemente como una herramienta de vigilancia y detección temprana del virus de la enfermedad de Newcastle, así como predecir los diferentes patotipos de aislados del virus.

  • English

    Newcastle disease virus is a highly contagious avian paramyxovirus and the main devastating poultry agent, causing high economic losses in the poultry industry around the world. In the present study, we characterized molecularly 8 partial gene sequences of the fusion protein and 3 complete sequences of the haemagglutinin-neuraminidase from isolated virus present in native poultry unvaccinated in the Southern Ecuador in 2014. These sequences were compared with other sequences of virus, representing different genotypes and sub-genotypes of virus from different regions of the world. All viruses showed the amino acid sequence 112GRQGRL117 in C-terminus extension of the F2 protein, and showed Leucine at the N-terminus extension of the F1 protein. Those sequences allowed us to determine that these viruses belonged to a type of lentogenic virus. Phylogenetic analysis showed that most of the Newcastle virus isolated in this region of Ecuador, were closely related to strains of genotype II Class II, consistent with the sequence lentogenic live-virus vaccine, La Sota and B1. Molecular characterization and phylogenetic study of the F and HN genes could reliably be used as a tool for monitoring and early detection of Newcastle disease virus, as well as to predict the different pathotypes of virus isolates.