Molecular analysis in chilean commercial gastropods based on 16s rrna, coi and its1-5.8s rdna-its2 sequences

• Felipe Aguilera-Muñoz ^[1] ; Fabiola Lafarga-Cruz ^[1] ; Cristian Gallardo-Escárate ^[1]
  1. [1] Universidad de Concepción

     Universidad de Concepción

     Comuna de Concepción, Chile

     
• Localización: Gayana, ISSN-e 0717-6538, ISSN 0717-652X, Vol. 73, Nº. 1, 2009, págs. 17-27
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Analisis molecular en gastropodos chilenos comerciales basados en las secuencias 16s rrna,. Coi y its1-5.8s rdna-its2
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    Los moluscos Gastrópodos son de los principales recursos marinos cultivados y comercializados en Chile. Hay especies nativas chilenas, como loco (Concholepas concholepas), locate (Thais chocolata), caracol trumulco (Chorus giganteus), lapas (Fissurella spp.) caracol tégula (Tegula atra), así como especies exóticas tales como abalón rojo (Haliotis rufescens) y abalón japonés (Haliotis discus hannai). A pesia: de su importancia como recursos marinos, son escasos los estudios de genética molecular, relaciones filogenéticas y la estimación de los parámetros genéticos poblacionales. El objetivo de este estudio es establecer un enfoque molecular, entre las principales especies comerciales de gastrópodos en Chile. Los genes mitocondriales 16S rRNA y el COI, y la región nuclear ribosomal ITS 1 -5.8SrDNA-ITS2 fueron amplificados por PCR y secuenciación. Se utilizó el análisis de Alineación para determinar relaciones sistemáticas en el nivel específico de las especies estudiadas. Los resultados revelaron que 7 especies se agrupan en 4 familias genéticamente distintas (Haliotidae, Trochidae, Muricidae y Fissurellidae). En comparación con la secuenciación de COI, las secuencias de 16S rRNA e ITS1 -5.8SrDNA- ITS2 fueron relativamente más conservada con un porcentaje de divergencia para 16S rDNAe ITS 1 -5.8SrDNA-ITS2 del 1,2% y 1,8%, respectivamente, en contraste con el valor del 10% obtenidos para COI en abalón.

  • English

    Gastropod mollusks are part of the principal marine resources cultivated and commercialized in Chile. There are native Chilean species such as loco (Concholepas concholepas), locate (Thais chocolata), trumulco snail (Chorus giganteus), keyhole limpets (Fissurella spp.), tegula snail (Tegula atra) as well as exotic species such as red abalone (Haliotis rufescens) and Japanese abalone (Haliotis discus hannai). Despite their importance as marine resources, molecular genetic studies establishing phylogenetic relationships and estimating population genetic parameters are scarce. The aim of this study is to establish a molecular approach among the main commercial gastropod species in Chile. The mitochondrial genes 16S rRNA and COI, and the nuclear ribosomal region ITSl-5.8SrDNA-ITS2 were amplified by PCR and sequencing. Alignment analysis was used to determine systematic relationships at the specific level for the species studied. The results revealed that 7 species are grouped in 4 genetically distinct families (Haliotidae, Trochidae, Muricidae and Fissurellidae). In comparison with COI sequencing, 16S rRNA and ITSl-5.8SrDNA-ITS2 sequencing were relatively more conserved with a divergence percentage for 16S rDNA and ITSl-5.8SrDNA-ITS2 of 1.2% and 1.8%, respectively, contrasting with the value of 10% obtained for COI in abalone.