La biodiversidad bacteriana en las aguas mineromedicinales y sus perfiles de resistencia a los antibióticos es un tema en desarrollo en Ecuador. El objetivo del trabajo fue conocer la microbiota bacteriana y la resistencia a los antibióticos en aguas del balneario “Termas de Santagua Chachimbiro”, Provincia de Imbabura-Ecuador. Se recolectaron 16 muestras de agua. El aislamiento de las colonias bacterianas se obtuvo por la técnica de filtración en membrana, utilizando diferentes medios de cultivos. La identificación se realizó de acuerdo con los esquemas propuestos por MacFaddin (2003), complementados con las pruebas de las galerías Microgen. El perfil de resistencia a los antibióticos se determinó por el método de difusión en placas de Kirby y Bauer (1966). Se aislaron e identificaron 85 cepas bacterianas de las cuales el 61 % resultaron Gram negativas y 39 % Gram positivas. Las especies identificadas fueron Aeromonas caviae, Aeromonas eucrenophila, Aeromonas hydróphila, Aeromonas media, Aeromonas salmonicida, Aeromonas schubertii, Bacillus subtilis, Bacillus mycoides, Bacillus spp, Burkholderia cepacia, Citrobacter freundii, Comamonas spp, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas putida, Pseudomonas stutzeri, Ralstonia pickettii, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus lugdenensis, Staphylococcus saprophyticus, Staphylococcus spp, Staphylococcus warneri y Staphylococcus xylosus. En cuanto a la resistencia antimicrobiana la mayoría de las Gram negativas fueron resistentes a las penicilinas y cefalosporinas. Las Gram positivas a la oxacilina y penicilinas. El 66,67 % resultaron multirresistentes a más de tres antibióticos. El balneario “Termas de Santagua de Chachimbiro” presenta diversidad de especies bacteriana y la presencia de resistomas ambientales.
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