Molecular diversity among domestic guinea-pigs (Cavia porcellus) and their close phylogenetic relationship with the Andean wild species Cavia tschudii

• ÁNGEL E SPOTORNO ^[1] ; JOHN P VALLADARES ^[1] ; JUAN C MARÍN ^[1] ; HORACIO ZEBALLOS ^[2]
  1. [1] Universidad de Chile

     Universidad de Chile

     Santiago, Chile

     
  2. [2] Pontificia Universidad Católica de Chile

     Pontificia Universidad Católica de Chile

     Santiago, Chile

     
• Localización: Revista chilena de historia natural, ISSN-e 0717-6317, ISSN 0716-078X, Vol. 77, Nº. 2, 2004, págs. 243-250
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Diversidad molecular entre cuyes domésticos (Cavia porcellus) y su relación filogenética cercana con la especie silvestre andina Cavia tschudii
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• Resumen
  • español

    Para investigar el origen y la divergencia de los cuyes domésticos Cavia porcellus (Linnaeus, 1758; Rodentia, Caviidae), secuenciamos el gen mitocondrial para citocromo b de 12 especímenes domésticos y 10 silvestres de seis especies, incluyendo las dos que se presumen como ancestro de la doméstica: C. tschudii y C. aperea. Todos los análisis de máxima parsimonia y máxima verosimilitud agruparon a C. porcellus con C. tschudii (promedio de distancias K2P = 3,2 %); los mejores árboles tenían 609 pasos (CI = 0,796; Índice de Apoyo de Bremer (SI) = 28), y un _Ln = 4.419,52; con apoyos de remuestreo de 100 % y 97 % respectivamente. Dicho clado también apareció en el análisis cladístico de los aminoácidos correspondientes, apoyado por tres sustituciones y 96 % remuestreo. Cuando el nodo de C. aperea fue forzado a unirse al de C. porcellus, estos árboles fueron consistentemente más largos, menos probables y robustos, y con menos caracteres definitorios que el óptimo. Todas las secuencias de C. porcellus se agruparon también en un nodo definido por 15 sustituciones. El subnodo con animales de mercados de ciudad, tiendas de mascota y laboratorios se caracterizó por cuatro sustituciones (una no silenciosa, SI = 7 y 91 % remuestreo). Los C. porcellus sudamericanos, llamados "criollos" por los criadores locales, son más diversos. Probablemente, un clado del sur del Perú y Chile representa un linaje precolombino. La distancia K2P promedio entre C. tschudii y aperea fué más bien grande, 7,7 %. Cavia apareció como un nodo robusto (100 % remuestreo). Estos resultados indican que C. tschudii es la especie más cercanamente relacionada a C. porcellus.

  • English

    To investigate the origin and diversity of domestic guinea-pigs Cavia porcellus (Linnaeus, 1758; Rodentia, Caviidae), we sequenced the mitochondrial cytochrome b gene of 12 domestic and 10 wild specimens from six species, including the two presumed as ancestral to the domestic one: Cavia tschudii and Cavia aperea. All maximum parsimony and maximum likelihood analyses grouped C. porcellus with C. tschudii (mean K2P distance = 3.2 %); best trees had 609 steps (CI = 0.796; Bremer support Index (SI) = 28), and a _Ln = 4419.52, with 100 % and 97 % bootstrap support respectively. This clade, supported by three substitutions and 96 % bootstrap, is also obtained in the cladistic analysis of corresponding amino acids. When the C. aperea node was forced to join C. porcellus, these trees were consistently longer, less likely and robust, and with less defining characters than the optimal one. All C. porcellus sequences also clustered in a node defined by 15 substitutions. The sub-node containing animals from city markets, pet shops and laboratories was characterized by four substitutions (one non-silent, SI = 7, and 91 % bootstrap). Some South American C. porcellus, called "criollos" (creoles) by local breeders, were more diverse. Probably, a particular clade from southern Peru and Chile may represent a pre-Columbian lineage. Mean K2P distance between C. tschudii and C. aperea was rather large, 7.7 %. Cavia appeared as a robust node (100 % bootstrap). These results indicate that C. tschudii is the species most closely related to C. porcellus