Resumen de Caracterización morfométrica y molecular de poblaciones de Radopholus similis [(Cobb) Thorne (Rhabditida: Pratylenchidae)] en Colombia

Ángela María Chaves-Velasquez, Óscar Adrián Guzmán-Piedrahita, Arnubio Valencia Jiménez, Bernardo Villegas Estrada

• español

  Resumen Objetivo: Estudiar la variabilidad intraespecífica en diferentes poblaciones de Radopholus similis. Alcance: Poblaciones de R. similis provenientes principalmente del Bajo Occidente de Caldas, Colombia. Metodología: Se midieron 19 caracteres morfométricos y alométricos en hembras y machos de R. similis recolectados en los municipios de Anserma, Belalcázar, Carepa y Palestina, los cuales fueron analizadosmediante componentes principales y de conglomerados jerárquicos. Igualmente, se amplificó por PCR y se secuenció la región parcial ITS1-5.8S-ITS2 y el gen 18S del ARN ribosomal correspondiente a las poblaciones de R. similis antes mencionadas.Con estas secuencias, y 61 secuencias adicionales obtenidas de la base de datos del NCBI, se construyó una red haplotípica para detectar la variación genética de la especie. Resultados principales: La caracterización morfométrica mostró que las hembras de R. similis procedentes de Anserma y Belalcázar presentaron un esófago más alargado y las recolectadas de Palestina fueron más robustas en la región anterior al nivel de la base del estilete, con cuerpos y esófagos más alargados. El análisis molecular de la región ITS1-5.8S-ITS2 del ARN ribosomal no mostró variabilidad intraespecífica entre las poblaciones de R. similis estudiadas. Sin embargo, la red haplotípica construida en este estudio, junto con la recolectada de la base de datos del NCBI, reveló variabilidad intraespecífica entre las poblaciones de R. similis provenientes de África y del Sudeste Asiático. Conclusiones: No fue posible detectar variabilidad molecular entre las poblaciones de R. similis estudiadas.Sin embargo, sí se encontró variabilidad morfométrica entre las poblaciones de R. similisprocedentes de Anserma, Belalcázar, Carepa y Palestina, Colombia.

• English

  Abstract Objective: To study the intraspecific variability in different populations of Radopholus similis. Scope: R. similis populations coming mainly from the Southwest of Caldas-Colombia. Methodology: Nineteen morphometric and allometric characters were measured in females and males of R. similis collected in the municipalities of Anserma, Belalcázar, Carepa and Palestina, which were analyzed using principal components and hierarchical clusters. Likewise, the partial ITS1-5.8S-ITS2 and the 18S gene of the rRNA ribosomal corresponding to the populations of R. similis were amplified by PCR and sequenced. With these sequences, and 61 additional sequences obtained from the NCBI database, a haplotype network was built to detect the genetic variation of the species. Main Results: The morphometric characterization showed that R. similis females from the municipalities of Anserma and Belalcázar had a more elongated esophagus, and those from the municipality of Palestina were more robust in the region above the level of the base of the stylet, with more elongated bodies and esophagus. Molecular analyzes of the ITS1-5.8S-ITS2 region of the rRNA did not show intraspecific variability among the of R. similis populations studied. However, the haplotypic network built in this study, together with that collected from the NCBI database, revealed intraspecific variability among R. similis populations of Africa and Southeast Asia. Conclusions: It was not possible to detect molecular variability among the R. similis populations studied. However, morphometric variability was found among R. similis populations from the municipalities of Anserma, Belalcázar, Carepa, and Palestina, Colombia.