Detección y caracterización molecular del potato virus b (pvb) en papa criolla (solanum phureja) en Antioquia

• Autores: Susana GIRALDO RAMÍREZ, Andrea Sierra Mejía, María Isabella OSPINA ORTIZ, Mónica Higuita, Yuliana Gallo García, Pablo Gutiérrez Sánchez, Mauricio Marín Montoya
• Localización: Acta biológica colombiana, ISSN 0120-548X, Vol. 27, Nº. 2, 2022, págs. 258-268
• Idioma: español
• Títulos paralelos:
  • Detection and molecular characterization of potato virus B (PVB) in Solanum phureja in Antioquia
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    RESUMEN La papa criolla es uno de los principales productos agrícolas de la región Andina de Colombia. Este cultivo es afectado por diferentes enfermedades de origen viral, siendo los virus PYVV, PVS, PLRV y PVV algunos de los agentes causales más importantes. Con el fin de aportar nueva información al conocimiento del viroma de la papa criolla en Colombia, en este estudio se utilizó secuenciación de alto rendimiento (HTS) y RT-PCR cuantitativa (RT-qPCR) para la detección y caracterización molecular del Potato virus B (PVB), a partir de muestras de tejido foliar de plantas procedentes de diferentes lotes de papa criolla en Antioquia. Mediante análisis bioinformáticos fue posible el ensamblaje de la mayor parte del genoma de PVB, consistente de dos segmentos de 7,126 nt (ARN1) y 4,298 nt (ARN2) que codifican para dos poliproteínas (P1 y P2). Con las secuencias obtenidas se diseñaron primers específicos para la detección del PVB por RT-qPCR y RT-PCR convencional. Los resultados indicaron niveles medios de prevalencia (35 %) del PVB en los cultivos de papa criolla evaluados y su ausencia en las 20 muestras evaluadas de S. tuberosum var. Diacol-Capiro. Las metodologías utilizadas en este estudio pueden ser empleadas para el establecimiento de un programa de seguimiento epidemiológico de PVB en Colombia y otros países andinos.

  • English

    ABSTRACT Papa criolla is one of the most important agricultural products in the Colombian Andean region. Viral diseases, mostly caused by PYVV, PVS, PLRV and PVV, are one of the most limiting factors that constraint the productivity of this crop. In order to gain new knowledge of the S. phureja virome in Colombia, in this study using high-throughput sequencing (HTS) and quantitative RT-PCR (RT-qPCR) we present the first report of a natural infection with Potato virus B (PVB) in this country. PVB was detected in leaf samples from different S. phureja plots in Antioquia. Using bioinformatics analysis, it was possible to get the genome assembly of PVB, which comprised two segments of 7.126 nt (RNA1) and 4.298 nt (RNA2) coding for polyproteins P1 and P2. Genome sequences were used to design PVB-specific primers for RT-PCR and RT-qPCR. PVB was found in 35 % of S. phureja samples but was not detected in 20 samples of S. tuberosum var. Diacol-Capiro. The methodology used in this study could be useful in a PVB epidemiology surveillance program in Colombia and other Andean countries.