Integrase strand transfer inhibitors resistance-associated mutations in HIV-infected pregnant women

• Autores: Diego Cecchini, Javier Sfalcin, Inés Zapiola, Alan Gómez, Silvina Fernández Giuliano, Claudia Rodríguez, Lilia Mammana, Analía Seravalle, Fabian Fay, María Cecilia Torroija, Gabriela Bugarín, María Belén Bouzas
• Localización: Revista Española de Quimioterapia, ISSN-e 0214-3429, Vol. 37, Nº 6, 2024, págs. 479-485
• Idioma: inglés
• Títulos paralelos:
  • Resistencia a los inhibidores de integrasa en embarazadas con VIH
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• Resumen
  • español

    Objetivo. Hasta la fecha, no existen datos sobre la prevalencia de mutaciones asociadas a la resistencia (HIVDRM) a los inhibidores de la integrasa (INSTI) en mujeres embarazadas infectadas por VIH (HPW) en América Latina. Describimos la prevalencia y la transmisibilidad de las HIVDRM de la integrasa en una cohorte histórica de HPW naive de INSTI de Argentina (n=56) mediante Next Generation Sequencing (NGS).

    Material y métodos. Se realizó un análisis bioinformático mediante el software HyDRA para umbrales de sensibilidad del 20%, 10%, 5%, 2% y 1%. Calculamos la carga viral mutacional para cada INSTI-HIVDRM, considerando aquellas con >1000 c/mL como de alto riesgo de transmisibilidad.

    Resultados. El subtipo de VIH predominante fue BF (78,5%). No se detectaron HIVDRM principales con el filtro de secuenciación poblacional del 20%. Con un umbral del 1%, la prevalencia aumentó al 8,9%; se encontraron las mutaciones Y143C/S, E92G, E138K y T66I. La mediana (rango) de la carga mutacional (expresada en c/mL) fue: 355 (50,2-11705); con solo 1 caso >1000 c/mL. Las mutaciones accesorias (G163R/K,T97A) se detectaron principalmente con un umbral de sensibilidad del 20%, con una prevalencia general del 23,2%; la mediana (RIQ) de la carga mutacional fue: 23929 (4009-63158) c/mL;todas ellas por encima de 1000 c/mL.

    Conclusión. Nuestros resultados muestran evidencia de la presencia de INSTI-HIVDRM principales como mutaciones aleatorias y una alta frecuencia de mutaciones accesorias con potencial transmisibilidad en HPW.

  • English

    Objective. To date, no data exist regarding the prevalence of integrase inhibitor (INSTI) resistance-associated mutations (HIVDRM) in HIV-infected pregnant women (HPW) in Latin America. We describe the prevalence and transmissibility of integrase HIVDRM in a historical cohort of INSTI-naïve HPW from Argentina (n=56) with Next Generation Sequencing (NGS).

    Material and methods. Bioinformatics analysis was performed by HyDRA software for 20%, 10%, 5%, 2%, and 1% sensitivity thresholds. We calculated the mutational viral load for each INSTI-HIVDRM, considering those with >1000 c/mL as of high risk of transmissibility.

    Results. The predominant HIV subtype was BF (78.5%). Major HIVDRM were not detected with the population sequencing 20% filter. With a 1% threshold, the prevalence increased to 8.9%; Y143C/S, E92G, E138K, and T66I mutations were found. The median (range) mutational load (expressed in c/mL) was: 355 (50.2-11705); with only 1 case >1000 c/mL Accessory mutations (G163R/K, T97A) were detected mostly with a 20% sensitivity threshold with an overall prevalence of 23.2%; the median (IQR) mutational load was: 23929 (4009-63158) c/mL; all of them above 1000 c/mL.

    Conclusion. Our results show evidence of the presence of major INSTI-HIVDRM as aleatory mutations and a high frequency of accessory mutations with potential transmissibility in HPW.