Resumen de Identificación de genes homólogos a inhibidores de proteasas presentes en el genoma del oomiceto patógeno de la familia de las solanáceas

Estefanía Ramírez Delgado, Verónica Ancona, Gustavo A. Frías Treviño, José Luis Hernández Mendoza, Israel García León, Jesús Di Carlo Quiroz Velásquez

• español

  La secuenciación de genomas de diversos patógenos del género Phytophtora ha conducido a la identificación de genes que codifican proteínas efectoras que permiten la evasión y manipulación de la defensa de la planta. El objetivo de la investigación fue la búsqueda e identificación de secuencias homólogas a proteínas inhibidoras de proteasas y glucanasas, dentro del genoma de P. capsici (CPV-282) aislado de chile en México. La Metodología consistió en analizar inhibidores de proteínas extracelulares (EPI), inhibidores de proteasas con dominios tipo cistatina (EPIC) y proteínas inhibidoras de glucanasas (GIP) reportadas en Phytophtora infestans, Phytophtora sojae, Phytophtora ramorum y Phytophtora brassicae. Resultados obtenidos: El análisis in silico reveló la presencia de genes homólogos a EPI10, EPIC3, PiGIP y PsGIP, a partir de los cuales se diseñaron oligonucleotidos para confirmar la predicción del análisis bioinformático. Las secuencias obtenidas de los productos amplificados por Reacción en Cadena de la Polimerasa permitieron identificar secuencias homólogas a inhibidores de proteasas tipo cistatina (PcEPIC3) e inhibidores de glucanasas (PcGIP), dentro del genoma de P. capsici. Los resultados sugieren que el género Phytophthora comparte herramientas genéticas que le permiten manipular los sistemas de defensa de la planta y así ser eficientes en la colonización de su hospedero. 

• English

  The sequencing of genomes of various pathogens of the Phytophtora genus has led to the identification of genes encoding effector proteins that allow evasion and manipulation of plant defense. The objective of the research was the search and identification of sequences homologous to protease and glucanase inhibitor proteins within the genome of P. capsici (CPV-282) isolated from chili in Mexico. The methodology consisted of analyzing extracellular protein inhibitors (EPI), protease inhibitors with cystatin-like domains (EPIC) and glucanase inhibitor proteins (GIP) reported in Phytophtora infestans, Phytophtora sojae, Phytophtora ramorum and Phytophtora brassicae. Results obtained: The in silico analysis revealed the presence of homologous genes to EPI10, EPIC3, PiGIP and PsGIP, from which oligonucleotides were designed to confirm the prediction of the bioinformatics analysis. The sequences obtained from the products amplified by Polymerase Chain Reaction allowed the identification of sequences homologous to cystatin-type protease inhibitors (PcEPIC3) and glucanase inhibitors (PcGIP) within the P. capsici genome. The results suggest that the Phytophthora genus shares genetic tools that allow it to manipulate the plant's defense systems and thus be efficient in the colonization of its host.