Esta tesis ha sido estructurada en 4 capítulos independientes pero que guardan entre sí un nexo de unión al contribuir a la caracterización del caballo de pura raza española (P.R.E.) y de forma particular de la población cartujana, al ser considerada como la estirpe de mayor pureza genética dentro del P.R.E., debido al tipo de endocria cerrada mantenida desde el siglo XV. El primer capítulo, "estructura genealógica de la población del caballo de pura raza española. Influencia de la estirpe cartujana", es un estudio de la estructura genealógica de la población del caballo de P.R.E., esencial en cuanto nos ha permitido determinar el grado de información suministrada por el libro de registro racial hasta el año 1991. En una segunda parte se ha abordado el análisis de la influencia que ha mantenido la estirpe cartujana a lo largo de los distintos períodos generacionales. Así mismo se ha realizado el estudio pormenorizado de la relación entre el nivel de influencia cartujana dentro de las diferentes ganaderias y la capacidad reproductiva, reflejada en el número de descendientes producidos. El segundo capítulo, "la endocria en el caballo de pura raza española", ha realizado un profundo estudio de la cría consanguinea del P.R.E. y de la estirpe cartujana, comparando los niveles de endogamia de ambas poblaciones mediante diferentes metodologías de estimación del coeficiente de consanguinidad y analizando al mismo tiempo el efecto que produce la reproducción consanguínea en variables de tipo reproductivo, morfológico y productivo. Se ha dedicado un tercer capítulo, "variabilidad genética del caballo de pura raza española mediante marcadores genéticos", a estudiar la variabilidad genética del P.R.E. y de la estirpe cartujana mediante 17 marcadores genéticos, variabilidad que ha sido calculada a partir de la heterocigosidad, del número de alelos expresados y a partir del coeficiente de consanguinidad obtenido a partir del x2 del
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