La administración de metadona provoca en el animal de experimentación, tanto por vía intraperitoneal como por vía intramuscular, en periodos de tratamiento de uno y tres meses, alteraciones en músculos esqueléticos, hígado y riñón. En los músculos esqueléticos aparecieron fenómenos de fibrosis, degeneración y regeneración, que se ponen en relación no solo con los microtraumatismos locales por la inserción de la aguja, sino también por acción de la metadona tanto como efecto local, como sistémico. Los músculos más afectados fueron aquellos en los que predominan fibras tipo i. En hígado se observa una hepatitis reactiva inespecífica y signos de colostasis intracelular. A nivel renal solamente se observaron fenómenos de congestión y dilatación de los capilares de la cortical y particularmente en la medular.
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