Análisis cinético de sistemas enzimáticos. Desarrollo de un programa informático y su aplicación a mecanismos de reacción tetrasustrato

• Autores: Juan Miguel Yago Cantó
• Directores de la Tesis: Ramón Varón Castellanos (dir. tes.), Carmelo Garrido del Solo (dir. tes.), Manuela García Moreno (dir. tes.)
• Lectura: En la Universidad de Castilla-La Mancha ( España ) en 2013
• Idioma: español
• Tribunal Calificador de la Tesis: Santos F. Otín Lacarra (presid.), María Llanos Amo Saus (secret.), Francisco García Canovas (voc.)
• Materias:
  • Física
    • Química física
      • Cinética química
    • Termodinámica
  • Química
    • Bioquímica
      • Enzimología
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• Resumen

  • Existe un cierto número de programas informáticos dedicados a la obtención de las ecuaciones cinéticas correspondientes al estado estacionario de los sistemas enzimáticos, sin embargo, algunos de ellos ya no están disponibles o presentan severas limitaciones para mecanismos complejos. En este trabajo hemos desarrollado un nuevo programa que supera estas dificultades, se adapta a las necesidades de los investigadores en enzimología y resulta fácil de manejar. Esta aplicación ha sido empleada, en primer lugar, para estudiar cuantitativamente la aplicación de la aproximación del equilibrio rápido, ampliamente usada en cinética enzimática. Para ello se ha usado a modo de ejemplo, el esquema de reacción de la enzima conocida en la literatura como TagD, que opera a través de un mecanismo de reacción tetrasustrato. La literatura referente a mecanismos de esta estequiometria es sensiblemente más escasa que la referente a tri o bisustrato. Esto es debido, por una parte al menor número de enzimas conocidos correspondientes a la misma, y por otra a la dificultad en la obtención de sus ecuaciones cinéticas y la complejidad intrínseca de las éstas. Por ello, en un segundo lugar, el programa se ha empleado en obtener las ecuaciones cinéticas de un número de mecanismo tetrasustrato, para a partir de ellas, proponer un método que permita su discriminación. Este mismo procedimiento genera indirectamente, en algunos mecanismos, vías para la determinación del orden de adición de los sustratos a las especies enzimáticas así como la evaluación de parámetros cinéticos globales.